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Gen

GARIN5B

golgi associated RAB2 interactor family member 5B

Resumen

Localización citogenética
19q13.42
Coordenadas
Cromosoma 19: 55.354.908–55.363.260 (GRCh38)
Exones
11 exones en 8,4 kb
Proteína
922 aminoácidos
También conocido como
DKFZp434G1729
Símbolos anteriores
C19orf16, FAM71E2
Transcrito MANE Select
ENST00000424985.3NM_001145402.2
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muy alta
  • Alta
  • Baja
  • Muy baja

Informes revisados relevantes para este gen

Ningún informe de Genome Test lee aún GARIN5B. La prueba secuencia todo su genoma, así que sus datos lo incluyen igualmente.

Estructura de GARIN5B

  • Secuencia codificante
  • Región no traducida
  • Intrón
  • Sentido de la transcripción
  • Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Cromosoma 19, con un corchete donde se ubica GARIN5B. GARIN5B y 51 genes cercanos en el cromosoma 19, desde 54.859.084 hasta 55.859.083.Cromosoma 1919q13.42p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4355 Mb55,2 Mb55,4 Mb55,6 Mb55,8 MbKIR3DL2: 54.850.433–54.867.209, hebra directaKIR3DL2FCAR: 54.874.227–54.891.420, hebra directaFCARNCR1: 54.906.112–54.941.199, hebra directaNCR1NLRP7: 54.923.454–54.966.312, hebra inversaNLRP7NLRP2: 54.953.130–55.001.142, hebra directaNLRP2GP6: 55.012.055–55.038.264, hebra inversaGP6RDH13: 55.039.108–55.071.291, hebra inversaRDH13EPS8L1: 55.072.020–55.090.124, hebra directaEPS8L1PPP1R12C: 55.090.913–55.117.679, hebra inversaPPP1R12CTNNT1: 55.131.662–55.149.351, hebra inversaTNNI3: 55.151.763–55.157.774, hebra inversaTNNI3: 55.154.757–55.160.671, hebra inversaDNAAF3: 55.158.661–55.166.722, hebra inversaDNAAF3SYT5: 55.171.196–55.180.328, hebra inversaSYT5PTPRH: 55.181.230–55.209.512, hebra inversaPTPRHTMEM86B: 55.226.524–55.228.784, hebra inversaTMEM86BPPP6R1: 55.229.776–55.259.070, hebra inversaPPP6R1HSPBP1: 55.262.219–55.280.930, hebra inversaHSPBP1BRSK1: 55.282.072–55.312.592, hebra directaBRSK1TMEM150B: 55.309.440–55.334.048, hebra inversaKMT5C: 55.339.367–55.348.122, hebra directaCOX6B2: 55.349.306–55.354.754, hebra inversaCOX6B2: 55.352.301–55.359.516, hebra inversaGARIN5B: 55.354.908–55.363.260, hebra inversaGARIN5BIL11: 55.364.382–55.370.463, hebra inversaIL11TMEM190: 55.376.816–55.378.246, hebra directaTMEM238: 55.379.244–55.384.305, hebra inversaRPL28: 55.383.856–55.403.342, hebra directaUBE2S: 55.385.311–55.408.164, hebra inversaSHISA7: 55.428.740–55.452.900, hebra inversaSHISA7ISOC2: 55.452.975–55.462.343, hebra inversaISOC2C19orf85: 55.463.001–55.464.752, hebra inversaC19orf85ZNF628: 55.476.597–55.484.487, hebra directaZNF628NAT14: 55.484.949–55.487.578, hebra directaSSC5D: 55.488.404–55.519.099, hebra directaSBK2: 55.528.607–55.537.143, hebra inversaSBK2SBK3: 55.539.018–55.550.284, hebra inversaSBK3ZNF579: 55.576.774–55.580.921, hebra inversaZNF579FIZ1: 55.591.371–55.606.194, hebra inversaFIZ1ZNF524: 55.599.714–55.603.592, hebra directaZNF524ZNF865: 55.605.502–55.617.269, hebra directaZNF865ZNF784: 55.620.741–55.624.570, hebra inversaZNF581: 55.624.664–55.647.294, hebra directaZNF580: 55.635.003–55.643.470, hebra directaCCDC106: 55.640.967–55.653.161, hebra directaU2AF2: 55.654.115–55.674.717, hebra directaEPN1: 55.675.109–55.709.858, hebra directaEPN1NLRP9: 55.708.438–55.738.402, hebra inversaNLRP9RFPL4A: 55.759.043–55.763.424, hebra directaRFPL4ARFPL4AL1: 55.769.118–55.773.420, hebra directaRFPL4AL1NLRP11: 55.785.397–55.836.800, hebra inversaNLRP11NLRP4: 55.836.540–55.881.855, hebra directaNLRP4Diagrama de GARIN5B: 11 exones en la hebra inversa del cromosoma 19Exón 11: 55.354.908–55.355.095, 188 basesExón 10: 55.355.260–55.355.345, 86 basesExón 9: 55.358.145–55.359.979, 1835 basesExón 8: 55.360.693–55.360.769, 77 basesExón 7: 55.360.853–55.360.905, 53 basesExón 6: 55.361.000–55.361.103, 104 basesExón 5: 55.361.174–55.361.238, 65 basesExón 4: 55.361.410–55.361.434, 25 basesExón 3: 55.362.245–55.362.503, 259 basesExón 2: 55.362.578–55.362.732, 155 basesExón 1: 55.362.917–55.363.260, 344 bases11109876543215′3′

Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.

Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).

Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.

Los exones suman 3,2 kb de los 8,4 kb del gen; 2769 de esas bases codifican la proteína.

Enlaces externos

De dónde procede

  • HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
  • MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.

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APA

Dante Labs. (s. f.). Gen GARIN5B: golgi associated RAB2 interactor family member 5B. Consultado el 19 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/garin5b

Vancouver

Dante Labs. Gen GARIN5B: golgi associated RAB2 interactor family member 5B [Internet]. [citado 19 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/garin5b

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