Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA
Zosekvenujte si svůj genom (otevře se na nové kartě)

Gen

GAPDH

glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase

Shrnutí

Cytogenetická poloha
12p13.31
Souřadnice
Chromozom 12: 6 534 517–6 538 371 (GRCh38)
Exony
9 exonů na 3,9 kb
Protein
335 aminokyselin
Předchozí symboly
GAPD
Transkript MANE Select
ENST00000229239.10NM_002046.7
Typ lokusu
Kódující proteiny
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen GAPDH. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je GAPDH uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom 12, se závorkou u GAPDH. GAPDH a 43 genů poblíž na chromozomu 12, od 6 036 444 do 7 036 443.Chromozom 1212p13.31p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.336,2 Mb6,4 Mb6,6 Mb6,8 Mb7 MbVWF: 5 948 877–6 124 770, řetězec zpětnémVWFCD9: 6 199 715–6 238 271, řetězec dopřednémCD9PLEKHG6: 6 310 167–6 328 934, řetězec dopřednémPLEKHG6TNFRSF1A: 6 328 757–6 342 114, řetězec zpětnémTNFRSF1ASCNN1A: 6 345 124–6 383 917, řetězec zpětnémSCNN1ALTBR: 6 375 045–6 391 571, řetězec dopřednémLTBRCD27: 6 444 933–6 451 718, řetězec dopřednémCD27TAPBPL: 6 451 690–6 466 517, řetězec dopřednémTAPBPLVAMP1: 6 462 237–6 470 948, řetězec zpětnémVAMP1MRPL51: 6 490 204–6 493 856, řetězec zpětnémMRPL51NCAPD2: 6 493 356–6 531 970, řetězec dopřednémNCAPD2GAPDH: 6 534 517–6 538 371, řetězec dopřednémGAPDHIFFO1: 6 538 961–6 556 102, řetězec zpětnémIFFO1NOP2: 6 556 863–6 568 691, řetězec zpětnémNOP2: 6 556 886–6 607 367, řetězec zpětnémCHD4: 6 570 081–6 614 982, řetězec zpětnémCHD4LPAR5: 6 618 835–6 636 444, řetězec zpětnémLPAR5ACRBP: 6 638 075–6 647 441, řetězec zpětnémACRBPING4: 6 650 282–6 663 180, řetězec zpětnémING4ZNF384: 6 665 037–6 689 572, řetězec zpětnémZNF384PIANP: 6 693 791–6 700 859, řetězec zpětnémPIANPCOPS7A: 6 724 014–6 732 462, řetězec dopřednémCOPS7AMLF2: 6 747 986–6 768 932, řetězec zpětnémMLF2PTMS: 6 765 516–6 770 952, řetězec dopřednémPTMSLAG3: 6 772 360–6 778 455, řetězec dopřednémLAG3CD4: 6 786 858–6 820 807, řetězec dopřednémCD4GPR162: 6 821 624–6 829 972, řetězec dopřednémGPR162P3H3: 6 828 220–6 839 867, řetězec dopřednémP3H3GNB3: 6 839 954–6 847 393, řetězec dopřednémGNB3CDCA3: 6 844 723–6 852 353, řetězec zpětnémUSP5: 6 852 098–6 866 632, řetězec dopřednémTPI1: 6 867 119–6 878 513, řetězec dopřednémSPSB2: 6 870 934–6 889 358, řetězec zpětnémLRRC23: 6 873 455–6 914 243, řetězec dopřednémLRRC23ENO2: 6 913 745–6 923 970, řetězec dopřednémENO2ATN1: 6 924 454–6 942 322, řetězec dopřednémATN1C12orf57: 6 942 919–6 946 009, řetězec dopřednémRNU7-1: 6 943 816–6 943 878, řetězec dopřednémRNU7-1PTPN6: 6 946 417–6 961 316, řetězec dopřednémPTPN6PHB2: 6 965 327–6 970 841, řetězec zpětnémEMG1: 6 970 765–6 979 939, řetězec dopředném: 6 970 921–6 997 428, řetězec dopřednémLPCAT3: 6 972 027–7 018 779, řetězec zpětnémC1S: 6 988 259–7 071 281, řetězec dopřednémC1SSchéma GAPDH: 9 exonů na dopředném řetězci chromozomu 12Exon 1: 6 534 517–6 534 569, 53 bázíExon 2: 6 534 810–6 534 861, 52 bázíExon 3: 6 536 494–6 536 593, 100 bázíExon 4: 6 536 684–6 536 790, 107 bázíExon 5: 6 536 920–6 537 010, 91 bázíExon 6: 6 537 101–6 537 216, 116 bázíExon 7: 6 537 309–6 537 390, 82 bázíExon 8: 6 537 584–6 537 996, 413 bázíExon 9: 6 538 101–6 538 371, 271 bází1234567895′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 1,3 kb z 3,9 kb genu; 1 008 těchto bází kódují protein.

Sekvenování GAPDH

31Vysoká

Jak obtížně se GAPDH sekvenuje krátkými čteními, ze 100

  • Mapovatelnost7,5 %
  • Homologie92 %
  • Repetice0,1 %
  • Obsah GC6,3 %
  • Pokrytí reference0 %

1

pozice v GAPDH, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní

Žádná z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.

Celé genomové sekvenování pokrývá všech 3,9 kb genu GAPDH, včetně intronů, nejen 1,3 kb exonů.

Externí odkazy

Odkud to pochází

  • HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zvládají.
  • Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.
  • Vydání dat 2026.10.17-8666dff2.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen GAPDH: glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/gapdh

Vancouver

Dante Labs. Gen GAPDH: glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/gapdh

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test