Gen
B4GALT3
beta-1,4-galactosyltransferase 3
- HGNC 926↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000158850↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 8703↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 1q23.3
- Koordinater
- Kromosom 1: 161 171 310–161 177 507 (GRCh38)
- Exoner
- 8 exoner på 6,2 kb
- Protein
- 393 aminosyror
- Även känd som
- beta4Gal-T3
- MANE Select-transkript
- ENST00000319769.10NM_003779.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/b4galt3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs B4GALT3, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser B4GALT3 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är B4GALT3 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1,9 kb av genens 6,2 kb, och 1 182 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av B4GALT3
0Låg
Hur svår B4GALT3 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av B4GALT3s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.0 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.4,4 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
1
position i B4GALT3 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsekvensering täcker alla 6,2 kb av B4GALT3, inklusive introner, inte bara de 1,9 kb exoner.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). B4GALT3-genen: beta-1,4-galactosyltransferase 3. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/b4galt3
Dante Labs. B4GALT3-genen: beta-1,4-galactosyltransferase 3 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/b4galt3
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor