Gene
TNFRSF8
TNF receptor superfamily member 8
- HGNC 11923↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000120949↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 943↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 1p36.22
- Coordenadas
- Cromossoma 1: 12 063 303–12 144 207 (GRCh38)
- Exões
- 15 exões ao longo de 80,9 kb
- Proteína
- 595 aminoácidos
- Também conhecido como
- KI-1
- Símbolos anteriores
- CD30, D1S166E
- Transcrito MANE Select
- ENST00000263932.7NM_001243.5
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
Esta página como dados
Acrescente .json ao endereço da página, ou peça application/json, para a ler como JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tnfrsf8.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameAnalise TNFRSF8, e o resto do seu genoma, com um único teste.
A partir de 449 $Envio gratuito · Resultados em 6–8 semanas
Obter o meu Genome TestRelatórios com curadoria relevantes para este gene
Nenhum relatório do Genome Test analisa TNFRSF8 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.
Como TNFRSF8 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 3,8 kb dos 80,9 kb do gene; 1788 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de TNFRSF8
6Fácil
Dificuldade de sequenciação de TNFRSF8 com leituras curtas, em 100
0 · Fácil100 · Difícil
Quase todos os exões de TNFRSF8 se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham com clareza.
O que acresce: a proporção dos exões de TNFRSF8 em cada tipo de região difícil
- MapeabilidadeTrechos onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessa zona pode estar em falta ou ser incorreta. Peso 100%.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutros pontos do genoma, como parálogos e pseudogenes, com identidade de 90% ou mais. Peso 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Peso 60%.0%
- Cobertura da referênciaLacunas nas proximidades na montagem de referência, onde não existe sequência à qual as leituras se possam alinhar. Peso 50%.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, nas quais as leituras escorregam e podem não as abranger. Peso 30%.0%
- Conteúdo GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre de forma insuficiente. Peso 20%.28%
Uma pontuação da Dante Labs, baseada na nossa própria investigação e construída sobre os mapas de regiões de difícil sequenciação Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuaçãoCada barra representa a proporção das bases dos exões de TNFRSF8 nesse tipo de região difícil. Qualquer tipo pode, por si só, tornar um gene difícil, e cada tipo adicional acrescenta menos: 0 quando nenhuma base está em nenhum, 100 quando todas as bases estão em regiões onde as leituras não podem ser posicionadas de forma única.
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene TNFRSF8: TNF receptor superfamily member 8. Consultado em 19 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/tnfrsf8
Dante Labs. Gene TNFRSF8: TNF receptor superfamily member 8 [Internet]. [consultado em 19 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/tnfrsf8
Um teste. Respostas para toda a vida.
A partir de 449 $Envio gratuito · Resultados em 6–8 semanas