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Gene

CSNK1E

casein kinase 1 epsilon

Resumo

Localização citogenética
22q13.1
Coordenadas
Cromossoma 22: 38 290 691–38 317 433 (GRCh38)
Exões
11 exões ao longo de 26,7 kb
Proteína
416 aminoácidos
Também conhecido como
HCKIE, CKIE, CKIepsilon
Transcrito MANE Select
ENST00000396832.6NM_152221.3
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa CSNK1E ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como CSNK1E está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 22, com um parêntese onde se situa CSNK1E. CSNK1E e 27 genes próximos no cromossoma 22, de 37 804 062 a 38 804 061.Cromossoma 2222q13.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3338 Mb38,2 Mb38,4 Mb38,6 Mb38,8 MbH1-0: 37 805 229–37 807 432, fita diretaH1-0GCAT: 37 807 872–37 817 386, fita diretaGCATGALR3: 37 822 198–37 825 851, fita diretaGALR3ANKRD54: 37 830 853–37 849 327, fita inversaANKRD54EIF3L: 37 848 868–37 889 407, fita diretaEIF3LMICALL1: 37 905 657–37 942 822, fita diretaMICALL1C22orf23: 37 943 050–37 953 669, fita inversaC22orf23POLR2F: 37 952 607–38 041 932, fita diretaPOLR2FSOX10: 37 970 686–37 987 422, fita inversaSOX10PICK1: 38 056 311–38 076 050, fita diretaPICK1SLC16A8: 38 078 134–38 084 186, fita inversaSLC16A8BAIAP2L2: 38 084 652–38 111 015, fita inversaBAIAP2L2PLA2G6: 38 111 495–38 214 778, fita inversaPLA2G6MAFF: 38 200 767–38 219 321, fita diretaMAFFTMEM184B: 38 215 914–38 273 805, fita inversaTMEM184BCSNK1E: 38 290 691–38 317 433, fita inversaCSNK1ETPTEP2-CSNK1E: 38 291 918–38 398 522, fita inversaTPTEP2-CSNK1EKCNJ4: 38 426 327–38 455 902, fita inversaKCNJ4KDELR3: 38 468 021–38 483 762, fita diretaKDELR3DDX17: 38 483 438–38 507 660, fita inversaDDX17DMC1: 38 509 022–38 570 211, fita inversaDMC1FAM227A: 38 578 118–38 656 629, fita inversaFAM227ACBY1: 38 656 375–38 673 920, fita diretaCBY1TOMM22: 38 681 924–38 687 684, fita diretaTOMM22JOSD1: 38 685 543–38 701 556, fita inversaJOSD1GTPBP1: 38 705 742–38 738 299, fita diretaGTPBP1SUN2: 38 733 280–38 794 198, fita inversaSUN2DNAL4: 38 778 505–38 794 198, fita inversaDNAL4Diagrama de CSNK1E: 11 exões na cadeia inversa do cromossoma 22Exão 11: 38 290 691–38 291 938, 1248 basesExão 10: 38 293 255–38 293 319, 65 basesExão 9: 38 294 109–38 294 248, 140 basesExão 8: 38 294 342–38 294 534, 193 basesExão 7: 38 298 786–38 298 934, 149 basesExão 6: 38 299 895–38 300 065, 171 basesExão 5: 38 300 724–38 300 952, 229 basesExão 4: 38 302 861–38 303 009, 149 basesExão 3: 38 303 138–38 303 248, 111 basesExão 2: 38 314 082–38 314 169, 88 basesExão 1: 38 317 160–38 317 433, 274 bases1110864215′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 2,8 kb dos 26,7 kb do gene; 1251 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de CSNK1E

7Baixo

Grau de dificuldade de sequenciar CSNK1E com leituras curtas, em 100

  • Mapeabilidade0%
  • Homologia0%
  • Repetições15%
  • Teor de GC43%
  • Cobertura de referência0%

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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Dante Labs. (s.d.). Gene CSNK1E: casein kinase 1 epsilon. Consultado em 18 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/csnk1e

Vancouver

Dante Labs. Gene CSNK1E: casein kinase 1 epsilon [Internet]. [consultado em 18 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/csnk1e

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