Ir al contenido
Use los fondos de su HSA o FSA
Secuencie su genoma (se abre en una pestaña nueva)

Gen

CSNK1E

casein kinase 1 epsilon

Resumen

Localización citogenética
22q13.1
Coordenadas
Cromosoma 22: 38.290.691–38.317.433 (GRCh38)
Exones
11 exones en 26,7 kb
Proteína
416 aminoácidos
También conocido como
HCKIE, CKIE, CKIepsilon
Transcrito MANE Select
ENST00000396832.6NM_152221.3
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muy alta
  • Alta
  • Baja
  • Muy baja

Informes revisados relevantes para este gen

Ningún informe de Genome Test lee aún CSNK1E. La prueba secuencia todo su genoma, así que sus datos lo incluyen igualmente.

Estructura de CSNK1E

  • Secuencia codificante
  • Región no traducida
  • Intrón
  • Sentido de la transcripción
  • Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Cromosoma 22, con un corchete donde se ubica CSNK1E. CSNK1E y 27 genes cercanos en el cromosoma 22, desde 37.804.062 hasta 38.804.061.Cromosoma 2222q13.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3338 Mb38,2 Mb38,4 Mb38,6 Mb38,8 MbH1-0: 37.805.229–37.807.432, hebra directaH1-0GCAT: 37.807.872–37.817.386, hebra directaGCATGALR3: 37.822.198–37.825.851, hebra directaGALR3ANKRD54: 37.830.853–37.849.327, hebra inversaANKRD54EIF3L: 37.848.868–37.889.407, hebra directaEIF3LMICALL1: 37.905.657–37.942.822, hebra directaMICALL1C22orf23: 37.943.050–37.953.669, hebra inversaC22orf23POLR2F: 37.952.607–38.041.932, hebra directaPOLR2FSOX10: 37.970.686–37.987.422, hebra inversaSOX10PICK1: 38.056.311–38.076.050, hebra directaPICK1SLC16A8: 38.078.134–38.084.186, hebra inversaSLC16A8BAIAP2L2: 38.084.652–38.111.015, hebra inversaBAIAP2L2PLA2G6: 38.111.495–38.214.778, hebra inversaPLA2G6MAFF: 38.200.767–38.219.321, hebra directaMAFFTMEM184B: 38.215.914–38.273.805, hebra inversaTMEM184BCSNK1E: 38.290.691–38.317.433, hebra inversaCSNK1ETPTEP2-CSNK1E: 38.291.918–38.398.522, hebra inversaTPTEP2-CSNK1EKCNJ4: 38.426.327–38.455.902, hebra inversaKCNJ4KDELR3: 38.468.021–38.483.762, hebra directaKDELR3DDX17: 38.483.438–38.507.660, hebra inversaDDX17DMC1: 38.509.022–38.570.211, hebra inversaDMC1FAM227A: 38.578.118–38.656.629, hebra inversaFAM227ACBY1: 38.656.375–38.673.920, hebra directaCBY1TOMM22: 38.681.924–38.687.684, hebra directaTOMM22JOSD1: 38.685.543–38.701.556, hebra inversaJOSD1GTPBP1: 38.705.742–38.738.299, hebra directaGTPBP1SUN2: 38.733.280–38.794.198, hebra inversaSUN2DNAL4: 38.778.505–38.794.198, hebra inversaDNAL4Diagrama de CSNK1E: 11 exones en la hebra inversa del cromosoma 22Exón 11: 38.290.691–38.291.938, 1248 basesExón 10: 38.293.255–38.293.319, 65 basesExón 9: 38.294.109–38.294.248, 140 basesExón 8: 38.294.342–38.294.534, 193 basesExón 7: 38.298.786–38.298.934, 149 basesExón 6: 38.299.895–38.300.065, 171 basesExón 5: 38.300.724–38.300.952, 229 basesExón 4: 38.302.861–38.303.009, 149 basesExón 3: 38.303.138–38.303.248, 111 basesExón 2: 38.314.082–38.314.169, 88 basesExón 1: 38.317.160–38.317.433, 274 bases1110864215′3′

Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.

Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).

Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.

Los exones suman 2,8 kb de los 26,7 kb del gen; 1251 de esas bases codifican la proteína.

Secuenciación de CSNK1E

7Fácil

Qué tan difícil es secuenciar CSNK1E con lecturas cortas, sobre 100

Casi todos los exones de CSNK1E se encuentran en zonas donde las lecturas cortas se alinean sin problemas.

Lo que suma: la proporción de los exones de CSNK1E en cada tipo de región difícil

  • Mapeabilidad0 %
  • Homología0 %
  • Repeticiones15 %
  • Contenido de GC43 %
  • Cobertura de referencia0 %

Una puntuación de Dante Labs basada en nuestra propia investigación, construida sobre los mapas de regiones difíciles de secuenciar Genome in a Bottle del NIST.Cómo se puntúa

Enlaces externos

De dónde procede

  • HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
  • MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
  • Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.

Citar esta página

APA

Dante Labs. (s. f.). Gen CSNK1E: casein kinase 1 epsilon. Consultado el 18 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/csnk1e

Vancouver

Dante Labs. Gen CSNK1E: casein kinase 1 epsilon [Internet]. [citado 18 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/csnk1e

Una prueba. Respuestas para toda la vida.

Desde 449 $Envío gratuito · Resultados en 6–8 semanas

Obtener mi Genome Test