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Gene

VAMP2

vesicle associated membrane protein 2

Sintesi

Localizzazione citogenetica
17p13.1
Coordinate
Cromosoma 17: 8.159.149–8.162.948 (GRCh38)
Esoni
5 esoni su 3,8 kb
Proteina
116 amminoacidi
Noto anche come
VAMP-2
Simboli precedenti
SYB2
Trascritto MANE Select
ENST00000316509.11NM_014232.3
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora VAMP2. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di VAMP2

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
Cromosoma 17, con una parentesi dove si trova VAMP2. VAMP2 e 36 geni nelle vicinanze sul cromosoma 17, da 7.661.049 a 8.661.048.Cromosoma 1717p13.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.37,8 Mb8 Mb8,2 Mb8,4 Mb8,6 MbTP53: 7.661.779–7.687.546, filamento inversoTP53WRAP53: 7.686.071–7.703.505, filamento direttoWRAP53EFNB3: 7.705.172–7.711.372, filamento direttoEFNB3DNAH2: 7.717.728–7.833.742, filamento direttoDNAH2KDM6B: 7.834.193–7.854.808, filamento direttoKDM6BTMEM88: 7.855.057–7.856.114, filamento direttoTMEM88NAA38: 7.856.681–7.885.238, filamento inversoNAA38CYB5D1: 7.857.696–7.862.282, filamento direttoCYB5D1CHD3: 7.884.787–7.912.760, filamento direttoRNF227: 7.913.238–7.916.377, filamento inversoKCNAB3: 7.920.956–7.929.856, filamento inversoKCNAB3: 7.925.931–7.930.622, filamento inversoTRAPPC1: 7.930.345–7.932.123, filamento inversoTRAPPC1CNTROB: 7.932.101–7.949.953, filamento direttoCNTROBGUCY2D: 8.002.615–8.020.342, filamento direttoGUCY2DALOX15B: 8.039.011–8.049.134, filamento direttoALOX15BALOX12B: 8.068.594–8.087.716, filamento inversoALOX12BALOXE3: 8.095.900–8.119.047, filamento inversoALOXE3HES7: 8.120.592–8.124.114, filamento inversoHES7PER1: 8.140.467–8.156.506, filamento inversoPER1: 8.150.816–8.162.975, filamento inversoVAMP2: 8.159.149–8.162.948, filamento inversoVAMP2TMEM107: 8.172.440–8.176.408, filamento inversoTMEM107BORCS6: 8.188.345–8.190.180, filamento inversoAURKB: 8.204.335–8.210.638, filamento inversoAURKBCTC1: 8.224.815–8.248.075, filamento inversoCTC1PFAS: 8.247.618–8.271.150, filamento direttoPFASSLC25A35: 8.287.762–8.295.410, filamento inversoSLC25A35RANGRF: 8.288.631–8.290.092, filamento direttoRANGRFARHGEF15: 8.310.222–8.323.203, filamento direttoARHGEF15ODF4: 8.339.840–8.346.048, filamento direttoODF4KRABD2: 8.356.902–8.376.738, filamento inversoKRABD2: 8.368.638–8.383.187, filamento inversoRPL26: 8.377.500–8.384.062, filamento inversoRNF222: 8.390.702–8.397.827, filamento inversoRNF222NDEL1: 8.408.528–8.501.107, filamento direttoNDEL1MYH10: 8.474.205–8.632.303, filamento inversoMYH10Diagramma di VAMP2: 5 esoni sul filamento inverso del cromosoma 17Esone 3: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 2: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 5: 8.159.149–8.160.871, 1723 basiEsone 4: 8.161.473–8.161.524, 52 basiEsone 3: 8.161.608–8.161.766, 159 basiEsone 2: 8.162.249–8.162.369, 121 basiEsone 1: 8.162.878–8.162.948, 71 basi543215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2,1 kb dei 3,8 kb del gene; 351 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge VAMP2

3

posizioni in VAMP2 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 3,8 kb di VAMP2, introni inclusi, non solo i 2,1 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene VAMP2: vesicle associated membrane protein 2. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/vamp2

Vancouver

Dante Labs. Gene VAMP2: vesicle associated membrane protein 2 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/vamp2

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