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Gene

PTPRN

protein tyrosine phosphatase receptor type N

Sintesi

Localizzazione citogenetica
2q35
Coordinate
Cromosoma 2: 219.289.623–219.309.401 (GRCh38)
Esoni
23 esoni su 19,8 kb
Proteina
979 amminoacidi
Noto anche come
IA-2, ICA512
Trascritto MANE Select
ENST00000295718.7NM_002846.4
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

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Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora PTPRN. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di PTPRN

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 2, con una parentesi dove si trova PTPRN. PTPRN e 38 geni nelle vicinanze sul cromosoma 2, da 218.799.512 a 219.799.511.Cromosoma 22q35p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3218,8 Mb219 Mb219,2 Mb219,4 Mb219,6 MbCYP27A1: 218.781.688–218.825.335, filamento direttoCYP27A1PRKAG3: 218.819.050–218.832.086, filamento inversoPRKAG3WNT6: 218.859.795–218.874.233, filamento direttoWNT6WNT10A: 218.880.852–218.899.581, filamento direttoWNT10ACDK5R2: 218.959.666–218.962.155, filamento direttoCDK5R2FEV: 218.981.087–218.985.566, filamento inversoFEVCRYBA2: 218.990.189–218.994.270, filamento inversoCRYBA2CFAP65: 219.002.846–219.041.527, filamento inversoCFAP65IHH: 219.054.424–219.061.064, filamento inversoIHHNHEJ1: 219.069.355–219.160.869, filamento inverso: 219.075.329–219.170.827, filamento inversoSLC23A3: 219.161.465–219.170.095, filamento inversoSLC23A3CNPPD1: 219.170.704–219.182.664, filamento inversoCNPPD1RETREG2: 219.176.225–219.185.917, filamento direttoRETREG2ZFAND2B: 219.195.237–219.209.651, filamento direttoABCB6: 219.209.765–219.219.012, filamento inverso: 219.209.772–219.222.738, filamento inversoATG9A: 219.219.380–219.230.383, filamento inversoANKZF1: 219.229.769–219.236.679, filamento direttoGLB1L: 219.236.598–219.245.478, filamento inversoSTK16: 219.245.212–219.250.339, filamento direttoTUBA4A: 219.249.710–219.277.902, filamento inversoTUBA4ATUBA4B: 219.253.243–219.272.197, filamento direttoTUBA4BDNAJB2: 219.279.308–219.286.900, filamento direttoDNAJB2PTPRN: 219.289.623–219.309.401, filamento inversoPTPRNRESP18: 219.327.407–219.335.552, filamento inversoRESP18DNPEP: 219.360.090–219.400.022, filamento inversoDNPEPDES: 219.417.474–219.426.740, filamento direttoDESSPEG: 219.434.471–219.493.629, filamento direttoSPEG: 219.491.867–219.498.244, filamento direttoSPEGNB: 219.496.129–219.498.287, filamento direttoSPEGNBGMPPA: 219.498.618–219.513.898, filamento direttoGMPPAASIC4: 219.514.170–219.538.772, filamento direttoASIC4CHPF: 219.538.949–219.543.818, filamento inversoCHPFTMEM198: 219.543.130–219.550.595, filamento direttoOBSL1: 219.550.727–219.572.076, filamento inversoOBSL1INHA: 219.569.162–219.575.711, filamento direttoSTK11IP: 219.595.805–219.616.452, filamento direttoSTK11IPSLC4A3: 219.627.011–219.641.982, filamento direttoSLC4A3Diagramma di PTPRN: 23 esoni sul filamento inverso del cromosoma 2Esone 23: 219.289.623–219.290.297, 675 basiEsone 22: 219.290.538–219.290.611, 74 basiEsone 21: 219.290.826–219.290.890, 65 basiEsone 20: 219.291.470–219.291.523, 54 basiEsone 19: 219.294.975–219.295.141, 167 basiEsone 18: 219.296.226–219.296.345, 120 basiEsone 17: 219.296.439–219.296.516, 78 basiEsone 16: 219.296.749–219.296.822, 74 basiEsone 15: 219.296.985–219.297.132, 148 basiEsone 14: 219.297.233–219.297.433, 201 basiEsone 13: 219.297.885–219.298.103, 219 basiEsone 12: 219.299.047–219.299.111, 65 basiEsone 11: 219.299.305–219.299.384, 80 basiEsone 10: 219.299.700–219.299.786, 87 basiEsone 9: 219.299.985–219.300.259, 275 basiEsone 8: 219.300.943–219.300.977, 35 basiEsone 7: 219.301.588–219.301.719, 132 basiEsone 6: 219.302.137–219.302.491, 355 basiEsone 5: 219.302.576–219.302.837, 262 basiEsone 4: 219.303.735–219.303.831, 97 basiEsone 3: 219.307.444–219.307.557, 114 basiEsone 2: 219.307.792–219.307.842, 51 basiEsone 1: 219.309.218–219.309.401, 184 basi2322201816141210864215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,6 kb dei 19,8 kb del gene; 2940 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene PTPRN: protein tyrosine phosphatase receptor type N. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/ptprn

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Dante Labs. Gene PTPRN: protein tyrosine phosphatase receptor type N [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/ptprn

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