Gene
NKX6-2
NK6 homeobox 2
- HGNC 19321↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000148826↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 84504↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 10q26.3
- Coordinate
- Cromosoma 10: 132.783.181–132.786.147 (GRCh38)
- Esoni
- 3 esoni su 3 kb
- Proteina
- 277 amminoacidi
- Noto anche come
- NKX6B, GTX, NKX6.1
- Trascritto MANE Select
- ENST00000368592.8NM_177400.3
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
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Altre leucodistrofie ereditarie
- Leucodistrofia (altri tipi e tipo non specificato)
Uno di 80 geni collegati ad esso
Patologie ereditarie che danneggiano o impediscono la normale formazione della mielina, la sostanza bianca del cervello e del midollo spinale. A seconda del gene coinvolto, i diversi tipi seguono un'ereditarietà autosomica recessiva, autosomica dominante o legata al cromosoma X.
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Conoscere la specifica causa genetica può porre fine a una ricerca diagnostica, guidare le cure di supporto e il monitoraggio, indicare se esiste un trattamento specifico e consentire il test dei familiari.
Struttura di NKX6-2
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 2,8 kb dei 3 kb del gene; 834 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge NKX6-2
10
posizioni in NKX6-2 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 3 kb di NKX6-2, introni inclusi, non solo i 2,8 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Condivide 1 condizione
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialCondivide 1 condizione
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Condivide 1 condizione
- ACER3alkaline ceramidase 3Condivide 1 condizione
- ADARadenosine deaminase RNA specificCondivide 1 condizione
- AIMP1aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1Condivide 1 condizione
- AIMP2aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 2Condivide 1 condizione
- ALDH3A2aldehyde dehydrogenase 3 family member A2Condivide 1 condizione
- ARSAarylsulfatase ACondivide 1 condizione
- ASPAaspartoacylaseCondivide 1 condizione
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11ACondivide 1 condizione
- CLCN2chloride voltage-gated channel 2Condivide 1 condizione
Tratti collegati a NKX6-2
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che NKX6-2 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal pyramidal sign
- Ataxia
- Dystonia
- Head titubation
- Increased reflexes
- Motor delay
- CNS hypomyelination
- Abnormal gait
Mostra altri 19 tratti
- Brain degeneration
- Degeneration of cerebellum
- Difficulty articulating speech
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Instability or lack of coordination of central trunk muscles
- Leukodystrophy
- Limb dystonia
- Loss of ability to walk
- Loss of developmental milestones
- Thin corpus callosum
- Cognitive impairment
- Degeneration of cerebrum
- Severe global developmental delay
- Intellectual disability
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Dysesthesia
- Limb ataxia
Abnormality of head or neck
- Wry neck
- Bulbous nose
- Dental crowding
- Failure of development of between one and six teeth
- Frontal bossing
- Gum enlargement
- High palate
- Long face
Mostra altri 1 tratto
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
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Dante Labs. (s.d.). Gene NKX6-2: NK6 homeobox 2. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/nkx6-2
Dante Labs. Gene NKX6-2: NK6 homeobox 2 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/nkx6-2
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