Gene
GNPNAT1
glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1
- HGNC 19980↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000100522↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 64841↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 14q22.1
- Coordinate
- Cromosoma 14: 52.775.193–52.791.607 (GRCh38)
- Esoni
- 6 esoni su 16,4 kb
- Proteina
- 184 amminoacidi
- Noto anche come
- Gpnat1, FLJ10607
- Trascritto MANE Select
- ENST00000216410.8NM_198066.4
- Tipo di locus
- Codificanti per proteine
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Questa pagina come dati
Aggiunga .json all'indirizzo della pagina, oppure richieda application/json, per leggerla come JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gnpnat1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLegga GNPNAT1 e il resto del suo genoma con un unico test.
A partire da 449 $Spedizione gratuita · Risultati in 6–8 settimane
Ottieni il mio Genome TestReport curati rilevanti per questo gene
Nessun report del Genome Test legge ancora GNPNAT1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.
Struttura di GNPNAT1
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 3,9 kb dei 16,4 kb del gene; 555 di queste basi codificano la proteina.
Sequenziamento di GNPNAT1
11Moderata
Quanto è difficile sequenziare GNPNAT1 con letture corte, su 100Ogni barra indica la quota di basi degli esoni di GNPNAT1 che si trovano in quel tipo di regione difficile. Il punteggio le pondera in base a quanto ciascuna pesa su una chiamata con letture corte: 0 quando nessuna base si trova in una regione di questo tipo, 100 quando ogni base si trova in tutte.
- MappabilitàTratti in cui le letture da 100 o 250 bp non possono essere collocate in modo univoco, quindi una chiamata in quelle zone potrebbe mancare o essere errata. Peso 35%.1%
- OmologiaDuplicazioni segmentali: copie altrove nel genoma, come paraloghi e pseudogeni, con identità del 90% o superiore. Peso 30%.31%
- RipetizioniRipetizioni in tandem e sequenze di una stessa base ripetuta, su cui le letture tendono a scivolare e che potrebbero non essere coperte per intero. Peso 15%.7,2%
- Contenuto di GCFinestre con meno del 25% o più del 65% di G e C, che la preparazione della libreria copre con difficoltà. Peso 10%.4,7%
- Copertura di riferimentoLacune nell'assemblaggio di riferimento vicine, dove non c'è una sequenza a cui le letture possano allinearsi. Peso 10%.0%
Tratti collegati a GNPNAT1
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che GNPNAT1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Abnormal formation of the hip
- Enlarged joints
- Excessive inward curvature of lower spine
- Flaring of rib cage
- Flattened vertebrae
- Funnel chest
- Limitation of joint mobility
- Posterior scalloping of vertebral bodies
Mostra altri 2 tratti
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene GNPNAT1: glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/gnpnat1
Dante Labs. Gene GNPNAT1: glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/gnpnat1
Un solo test. Risposte per tutta la vita.
A partire da 449 $Spedizione gratuita · Risultati in 6–8 settimane