Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

ZGPAT

zinc finger CCCH-type and G-patch domain containing

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
20q13.33
Koordináták
20. kromoszóma: 63 708 039–63 736 142 (GRCh38)
Exonok
7 exon, összesen 28,1 kb
Fehérje
511 aminosav
Más néven ismert
dJ583P15.3, MGC44880, FLJ14972, ZC3HDC9, ZC3H9, GPATC6, GPATCH6, ZIP
Korábbi jelölések
KIAA1847
MANE Select transzkriptum
ENST00000355969.11NM_181485.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) ZGPAT gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A ZGPAT felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
20. kromoszóma, a ZGPAT helyét zárójel jelöli. A ZGPAT és környékén 38 gén a 20. kromoszómán, 63 222 091–64 222 090 között.20. kromoszóma20q13.33p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3363,4 Mb63,6 Mb63,8 Mb64 Mb64,2 MbBIRC7: 63 235 435–63 240 497, előre szálBIRC7NKAIN4: 63 240 784–63 272 694, fordított szálNKAIN4ARFGAP1: 63 272 785–63 289 791, előre szálARFGAP1COL20A1: 63 293 186–63 334 851, előre szálCOL20A1CHRNA4: 63 343 223–63 378 401, fordított szálCHRNA4KCNQ2: 63 400 208–63 472 689, fordított szálKCNQ2EEF1A2: 63 477 488–63 500 533, fordított szálEEF1A2PPDPF: 63 520 255–63 532 108, előre szálPTK6: 63 526 306–63 537 770, fordított szálPTK6SRMS: 63 538 489–63 547 752, fordított szálSRMSFNDC11: 63 547 891–63 558 138, előre szálFNDC11HELZ2: 63 558 086–63 574 239, fordított szálHELZ2GMEB2: 63 587 601–63 628 426, fordított szálGMEB2STMN3: 63 639 705–63 657 682, fordított szálSTMN3RTEL1: 63 657 810–63 696 253, előre szálRTEL1RTEL1-TNFRSF6B: 63 659 300–63 698 684, előre szálTNFRSF6B: 63 696 368–63 698 689, előre szálARFRP1: 63 698 622–63 708 662, fordított szálZGPAT: 63 708 039–63 736 142, előre szálZGPAT: 63 708 864–63 739 103, előre szálLIME1: 63 736 283–63 739 108, előre szálLIME1: 63 738 270–63 740 398, előre szálSLC2A4RG: 63 739 758–63 744 603, előre szálZBTB46: 63 743 668–63 832 455, fordított szálABHD16B: 63 861 498–63 862 988, előre szálABHD16BTPD52L2: 63 865 199–63 892 266, előre szálTPD52L2DNAJC5: 63 894 641–63 939 899, előre szálDNAJC5UCKL1: 63 939 811–63 956 500, fordított szálUCKL1ZNF512B: 63 956 704–63 969 967, fordított szálZNF512BSAMD10: 63 973 610–63 980 008, fordított szálSAMD10PRPF6: 63 979 671–64 033 984, előre szálPRPF6C20orf204: 64 034 344–64 039 962, előre szálC20orf204SOX18: 64 047 582–64 050 629, fordított szálSOX18TCEA2: 64 049 836–64 072 352, előre szálTCEA2RGS19: 64 073 181–64 079 988, fordított szálRGS19OPRL1: 64 079 967–64 100 649, előre szálLKAAEAR1: 64 083 376–64 084 967, fordított szálMYT1: 64 102 222–64 242 253, előre szálMYT1NPBWR2: 64 103 802–64 107 565, fordított szálA ZGPAT ábrája: 7 exon a(z) 20. kromoszóma előre szálán1. exon: 63 708 039–63 708 118, 80 bázis2. exon: 63 708 553–63 709 164, 612 bázis3. exon: 63 733 219–63 733 352, 134 bázis4. exon: 63 733 587–63 733 739, 153 bázis5. exon: 63 734 705–63 734 824, 120 bázis6. exon: 63 735 159–63 735 564, 406 bázis7. exon: 63 735 781–63 736 142, 362 bázis124675′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 28,1 kb-jából 1,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1536 bázis kódolja a fehérjét.

ZGPAT szekvenálása

14Könnyű

Mennyire nehéz a ZGPAT rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A ZGPAT exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a ZGPAT exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések2,3%
  • GC-tartalom70%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). ZGPAT gén: zinc finger CCCH-type and G-patch domain containing. Lekérve: 2026. október 21., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/zgpat

Vancouver

Dante Labs. ZGPAT gén: zinc finger CCCH-type and G-patch domain containing [Internet]. [idézve: 2026. október 21.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/zgpat

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet