Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

TPD52L2

TPD52 like 2

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
20q13.33
Koordináták
20. kromoszóma: 63 865 270–63 891 538 (GRCh38)
Exonok
7 exon, összesen 26,3 kb
Fehérje
206 aminosav
Más néven ismert
D54, hD54, TPD54
MANE Select transzkriptum
ENST00000346249.9NM_003288.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) TPD52L2 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A TPD52L2 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
20. kromoszóma, a TPD52L2 helyét zárójel jelöli. A TPD52L2 és környékén 34 gén a 20. kromoszómán, 63 378 404–64 378 403 között.20. kromoszóma20q13.33p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3363,4 Mb63,6 Mb63,8 Mb64 Mb64,2 MbKCNQ2: 63 400 208–63 472 689, fordított szálKCNQ2EEF1A2: 63 477 488–63 500 533, fordított szálEEF1A2PPDPF: 63 520 255–63 532 108, előre szálPTK6: 63 526 306–63 537 770, fordított szálPTK6SRMS: 63 538 489–63 547 752, fordított szálSRMSFNDC11: 63 547 891–63 558 138, előre szálFNDC11HELZ2: 63 558 086–63 574 239, fordított szálHELZ2GMEB2: 63 587 601–63 628 426, fordított szálGMEB2STMN3: 63 639 705–63 657 682, fordított szálSTMN3RTEL1: 63 657 810–63 696 253, előre szálRTEL1RTEL1-TNFRSF6B: 63 659 300–63 698 684, előre szálTNFRSF6B: 63 696 368–63 698 689, előre szálARFRP1: 63 698 622–63 708 662, fordított szálZGPAT: 63 707 353–63 736 150, előre szál: 63 708 864–63 739 103, előre szálLIME1: 63 736 283–63 739 108, előre szálLIME1: 63 738 270–63 740 398, előre szálSLC2A4RG: 63 739 758–63 744 603, előre szálSLC2A4RGZBTB46: 63 743 668–63 832 455, fordított szálZBTB46ABHD16B: 63 861 498–63 862 988, előre szálABHD16BTPD52L2: 63 865 270–63 891 538, előre szálTPD52L2DNAJC5: 63 894 641–63 939 899, előre szálDNAJC5UCKL1: 63 939 811–63 956 500, fordított szálUCKL1ZNF512B: 63 956 704–63 969 967, fordított szálZNF512BSAMD10: 63 973 610–63 980 008, fordított szálSAMD10PRPF6: 63 979 671–64 033 984, előre szálPRPF6C20orf204: 64 034 344–64 039 962, előre szálC20orf204SOX18: 64 047 582–64 050 629, fordított szálSOX18TCEA2: 64 049 836–64 072 352, előre szálTCEA2RGS19: 64 073 181–64 079 988, fordított szálRGS19OPRL1: 64 079 967–64 100 649, előre szálLKAAEAR1: 64 083 376–64 084 967, fordított szálMYT1: 64 102 222–64 242 253, előre szálMYT1NPBWR2: 64 103 802–64 107 565, fordított szálPCMTD2: 64 254 921–64 304 820, előre szálPCMTD2A TPD52L2 ábrája: 7 exon a(z) 20. kromoszóma előre szálán1. exon: 63 865 270–63 865 384, 115 bázis2. exon: 63 869 296–63 869 441, 146 bázis3. exon: 63 873 668–63 873 816, 149 bázis4. exon: 63 875 816–63 875 875, 60 bázis5. exon: 63 882 719–63 882 820, 102 bázis6. exon: 63 889 190–63 889 238, 49 bázis7. exon: 63 889 850–63 891 538, 1689 bázis12345675′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 26,3 kb-jából 2,3 kb-ot tesznek ki; ezek közül 621 bázis kódolja a fehérjét.

TPD52L2 szekvenálása

3Könnyű

Mennyire nehéz a TPD52L2 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A TPD52L2 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a TPD52L2 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések0%
  • GC-tartalom16%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). TPD52L2 gén: TPD52 like 2. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/tpd52l2

Vancouver

Dante Labs. TPD52L2 gén: TPD52 like 2 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/tpd52l2

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet