Évalué par les pairs · iScience · 2023
Genomic evidence for adaptation to tuberculosis in the Andes before European contact
L’étude a analysé des génomes entiers à haute couverture de populations autochtones des hauts plateaux équatoriens afin d’identifier des signatures de sélection naturelle. Les signaux les plus marqués se situaient dans des régions immunitaires associées à la tuberculose, ce qui suggère une adaptation remontant à plusieurs milliers d’années avant le contact avec les Européens, ainsi qu’un grave effondrement démographique coïncidant avec leur arrivée.
Joseph et al.
L’étude a analysé des génomes entiers à haute couverture de populations autochtones des hauts plateaux équatoriens afin d’identifier des signatures de sélection naturelle. Les signaux les plus marqués se situaient dans des régions immunitaires associées à la tuberculose, ce qui suggère une adaptation remontant à plusieurs milliers d’années avant le contact avec les Européens, ainsi qu’un grave effondrement démographique coïncidant avec leur arrivée.
Participation de Dante Labs
Dante Labs a réalisé le séquençage du génome entier pour cette étude. Les banques, préparées à l’aide du kit NEB Ultra II Illumina et des index doubles uniques correspondants (New England Biolabs), ont été séquencées sur notre plateforme Illumina NovaSeq 6000 avec une couverture moyenne de 25x.
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