Peer-Review · iScience · 2023
Genomic evidence for adaptation to tuberculosis in the Andes before European contact
Die Studie analysierte vollständige Genome mit hoher Sequenzabdeckung von indigenen Menschen im ecuadorianischen Hochland, um Hinweise auf natürliche Selektion zu identifizieren. Die stärksten Signale fanden sich in mit Tuberkulose assoziierten Regionen des Immunsystems. Dies deutet auf eine Anpassung Tausende Jahre vor dem Kontakt mit Europäern hin. Zugleich zeigte sich ein drastischer Bevölkerungseinbruch, der zeitlich mit der Ankunft der Europäer zusammenfiel.
Joseph et al.
Die Studie analysierte vollständige Genome mit hoher Sequenzabdeckung von indigenen Menschen im ecuadorianischen Hochland, um Hinweise auf natürliche Selektion zu identifizieren. Die stärksten Signale fanden sich in mit Tuberkulose assoziierten Regionen des Immunsystems. Dies deutet auf eine Anpassung Tausende Jahre vor dem Kontakt mit Europäern hin. Zugleich zeigte sich ein drastischer Bevölkerungseinbruch, der zeitlich mit der Ankunft der Europäer zusammenfiel.
Beteiligung von Dante Labs
Dante Labs führte für diese Studie die Ganzgenomsequenzierung durch. Die mit dem NEB Ultra II Illumina Library Kit und den entsprechenden Unique Dual Indexes (New England Biolabs) vorbereiteten Bibliotheken wurden auf unserer Illumina NovaSeq 6000-Plattform mit einer mittleren Abdeckung von 25x sequenziert.
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