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Gène

SPHK2

sphingosine kinase 2

Résumé

Localisation cytogénétique
19q13.33
Coordonnées
Chromosome 19 : 48 619 506–48 630 405 (GRCh38)
Exons
7 exons sur 10,9 kb
Protéine
654 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000245222.9NM_020126.5
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SPHK2. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SPHK2

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de SPHK2. SPHK2 et 55 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 48 124 956 à 49 124 955.Chromosome 1919q13.33p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4348,2 Mb48,4 Mb48,6 Mb48,8 Mb49 MbLIG1 : 48 115 444–48 170 654, brin inverseLIG1ZSWIM9 : 48 170 645–48 197 624, brin directZSWIM9CARD8 : 48 180 770–48 255 976, brin inverseCARD8ZNF114 : 48 270 041–48 289 292, brin directZNF114ODAD1 : 48 296 355–48 321 971, brin inverseODAD1EMP3 : 48 321 310–48 330 560, brin directEMP3TMEM143 : 48 329 918–48 364 245, brin inverseTMEM143SYNGR4 : 48 364 260–48 376 377, brin directSYNGR4KDELR1 : 48 382 558–48 393 837, brin inverseKDELR1GRIN2D : 48 393 668–48 444 931, brin directGRIN2DGRWD1 : 48 445 512–48 458 382, brin directKCNJ14 : 48 454 464–48 466 980, brin directKCNJ14 : 48 465 837–48 472 431, brin directCYTH2 : 48 469 203–48 482 314, brin directCYTH2LMTK3 : 48 485 271–48 513 935, brin inverseLMTK3SULT2B1 : 48 552 140–48 599 425, brin directSACK1E : 48 599 961–48 615 093, brin inverseSPACA4 : 48 606 742–48 607 962, brin directRPL18 : 48 615 284–48 619 213, brin inverseRPL18SPHK2 : 48 619 506–48 630 405, brin directSPHK2DBP : 48 630 030–48 637 695, brin inverseDBPCA11 : 48 637 946–48 646 386, brin inverseCA11NTN5 : 48 661 407–48 673 081, brin inverseNTN5FUT2 : 48 695 953–48 705 951, brin directFUT2MAMSTR : 48 711 737–48 719 966, brin inverseMAMSTRRASIP1 : 48 720 571–48 740 616, brin inverseRASIP1IZUMO1 : 48 740 852–48 746 909, brin inverseIZUMO1FUT1 : 48 748 011–48 755 390, brin inverseFUT1FGF21 : 48 755 524–48 758 333, brin directBCAT2 : 48 795 061–48 811 066, brin inverseBCAT2HSD17B14 : 48 813 014–48 837 064, brin inverseHSD17B14PLEKHA4 : 48 837 091–48 868 855, brin inversePLEKHA4PPP1R15A : 48 872 212–48 879 061, brin directPPP1R15ATULP2 : 48 880 965–48 898 744, brin inverseTULP2NUCB1 : 48 900 050–48 923 958, brin directNUCB1DHDH : 48 933 517–48 944 969, brin directDHDHBAX : 48 954 815–48 961 806, brin directBAXFTL : 48 965 275–48 967 896, brin directFTLGYS1 : 48 968 125–48 993 349, brin inverseGYS1RUVBL2 : 48 993 476–49 017 868, brin directRUVBL2LHB : 49 015 980–49 017 091, brin inverseLHBSAXO3 : 49 017 968–49 020 549, brin inverseSAXO3CGB3 : 49 022 869–49 024 360, brin inverse : 49 022 953–49 036 895, brin inverseCGB2 : 49 031 890–49 033 238, brin directCGB1 : 49 035 569–49 036 895, brin inverseCGB5 : 49 043 595–49 045 312, brin directCGB8 : 49 047 638–49 049 125, brin inverseCGB7 : 49 054 274–49 058 860, brin inverseCGB7 : 49 055 793–49 065 076, brin inverseNTF4 : 49 061 066–49 065 076, brin inverseKCNA7 : 49 067 397–49 072 702, brin inverseKCNA7SNRNP70 : 49 085 164–49 108 618, brin directLIN7B : 49 114 324–49 118 463, brin directLIN7BC19orf73 : 49 118 402–49 119 143, brin inverseC19orf73PPFIA3 : 49 119 401–49 151 027, brin directSchéma de SPHK2 : 7 exons sur le brin direct du chromosome 19Exon 1 : 48 619 506–48 619 543, 38 basesExon 2 : 48 620 402–48 620 553, 152 basesExon 3 : 48 625 891–48 626 362, 472 basesExon 4 : 48 627 692–48 627 841, 150 basesExon 5 : 48 627 975–48 628 069, 95 basesExon 6 : 48 628 162–48 628 277, 116 basesExon 7 : 48 628 681–48 630 405, 1 725 bases12345675′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,7 kb sur les 10,9 kb du gène ; 1 965 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène SPHK2 : sphingosine kinase 2. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/sphk2

Vancouver

Dante Labs. Gène SPHK2 : sphingosine kinase 2 [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/sphk2

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