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Gène

ZSWIM9

zinc finger SWIM-type containing 9

Résumé

Localisation cytogénétique
19q13.33
Coordonnées
Chromosome 19 : 48 170 680–48 197 620 (GRCh38)
Exons
4 exons sur 26,9 kb
Protéine
920 acides aminés, 101,7 kDa
Aussi appelé
LOC374920
Symboles précédents
C19orf68
Transcrit MANE Select
ENST00000614654.2NM_199341.4
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore ZSWIM9. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de ZSWIM9

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de ZSWIM9. ZSWIM9 et 34 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 47 684 150 à 48 684 149.Chromosome 1919q13.33p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4347,8 Mb48 Mb48,2 Mb48,4 Mb48,6 MbBICRA : 47 608 196–47 703 277, brin directBICRAEHD2 : 47 713 388–47 745 089, brin directEHD2NOP53 : 47 745 481–47 758 208, brin directNOP53SELENOW : 47 778 508–47 784 686, brin directSELENOWTPRX1 : 47 801 232–47 819 051, brin inverseTPRX1CRX : 47 819 779–47 843 330, brin directCRXTPRX2 : 47 859 235–47 861 721, brin directTPRX2SULT2A1 : 47 870 327–47 886 479, brin inverseSULT2A1BSPH1 : 47 968 046–47 992 170, brin inverseBSPH1ELSPBP1 : 47 994 632–48 025 154, brin directELSPBP1CABP5 : 48 029 383–48 044 079, brin inverseCABP5PLA2G4C : 48 047 843–48 111 390, brin inversePLA2G4CLIG1 : 48 115 444–48 170 654, brin inverseLIG1ZSWIM9 : 48 170 680–48 197 620, brin directZSWIM9CARD8 : 48 180 770–48 255 976, brin inverseCARD8ZNF114 : 48 270 041–48 289 292, brin directZNF114ODAD1 : 48 296 355–48 321 971, brin inverseODAD1EMP3 : 48 321 310–48 330 560, brin directEMP3TMEM143 : 48 329 918–48 364 245, brin inverseTMEM143SYNGR4 : 48 364 260–48 376 377, brin directSYNGR4KDELR1 : 48 382 558–48 393 837, brin inverseKDELR1GRIN2D : 48 393 668–48 444 931, brin directGRIN2DGRWD1 : 48 445 512–48 458 382, brin directGRWD1KCNJ14 : 48 454 464–48 466 980, brin directKCNJ14 : 48 465 837–48 472 431, brin directCYTH2 : 48 469 203–48 482 314, brin directCYTH2LMTK3 : 48 485 271–48 513 935, brin inverseSULT2B1 : 48 552 140–48 599 425, brin directSULT2B1SACK1E : 48 599 961–48 615 093, brin inverseSACK1ESPACA4 : 48 606 742–48 607 962, brin directSPACA4RPL18 : 48 615 284–48 619 213, brin inverseRPL18SPHK2 : 48 619 291–48 630 717, brin directDBP : 48 630 030–48 637 695, brin inverseCA11 : 48 637 946–48 646 386, brin inverseNTN5 : 48 661 407–48 673 081, brin inverseNTN5Schéma de ZSWIM9 : 4 exons sur le brin direct du chromosome 19Exon 1 : 48 170 680–48 170 714, 35 basesExon 2 : 48 171 794–48 172 077, 284 basesExon 3 : 48 182 455–48 182 767, 313 basesExon 4 : 48 194 653–48 197 620, 2 968 bases12345′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,6 kb sur les 26,9 kb du gène ; 2 763 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de ZSWIM9

10Facile

Difficulté de séquençage de ZSWIM9 avec des lectures courtes, sur 100

Presque tous les exons de ZSWIM9 se situent dans des zones où les lectures courtes se positionnent sans ambiguïté.

Facteur aggravant : la part des exons de ZSWIM9 située dans chaque type de région difficile

  • Mappabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Partagé avec le chrY0 %
  • Couverture de la référence0 %
  • Répétitions0,6 %
  • Teneur en GC49 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes des régions difficiles à séquencer de Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène ZSWIM9 : zinc finger SWIM-type containing 9. Consulté le 21 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/zswim9

Vancouver

Dante Labs. Gène ZSWIM9 : zinc finger SWIM-type containing 9 [Internet]. [consulté le 21 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/zswim9

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