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Gène

SLC13A3

solute carrier family 13 member 3

Résumé

Localisation cytogénétique
20q13.12
Coordonnées
Chromosome 20 : 46 557 828–46 651 459 (GRCh38)
Exons
13 exons sur 93,6 kb
Protéine
602 acides aminés
Aussi appelé
NADC3, SDCT2
Transcrit MANE Select
ENST00000279027.9NM_022829.6
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SLC13A3. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SLC13A3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 20, avec un crochet à l'emplacement de SLC13A3. SLC13A3 et 10 gènes à proximité sur le chromosome 20, de 46 104 644 à 47 104 643.Chromosome 2020q13.12p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3346,2 Mb46,4 Mb46,6 Mb46,8 Mb47 MbCD40 : 46 118 240–46 130 378, brin directCD40CDH22 : 46 173 737–46 309 009, brin inverseCDH22SLC35H1 : 46 345 980–46 364 460, brin inverseSLC35H1ELMO2 : 46 366 045–46 432 985, brin inverseELMO2ZNF840P : 46 459 441–46 495 558, brin directZNF840PZNF334 : 46 499 630–46 513 596, brin inverseZNF334OCSTAMP : 46 540 946–46 550 654, brin inverseOCSTAMPSLC13A3 : 46 557 828–46 651 459, brin inverseSLC13A3TP53RK : 46 684 344–46 689 664, brin inverseTP53RKSLC2A10 : 46 709 577–46 737 312, brin directSLC2A10EYA2 : 46 894 587–47 188 844, brin directEYA2Schéma de SLC13A3 : 13 exons sur le brin inverse du chromosome 20Exon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 13 : 46 557 828–46 560 198, 2 371 basesExon 12 : 46 563 414–46 563 551, 138 basesExon 11 : 46 566 229–46 566 390, 162 basesExon 10 : 46 575 573–46 575 685, 113 basesExon 9 : 46 583 572–46 583 669, 98 basesExon 8 : 46 588 059–46 588 163, 105 basesExon 7 : 46 589 160–46 589 255, 96 basesExon 6 : 46 592 404–46 592 529, 126 basesExon 5 : 46 596 157–46 596 342, 186 basesExon 4 : 46 599 971–46 600 037, 67 basesExon 3 : 46 610 446–46 610 609, 164 basesExon 2 : 46 613 460–46 613 725, 266 basesExon 1 : 46 651 311–46 651 459, 149 bases131210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4 kb sur les 93,6 kb du gène ; 1 809 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de SLC13A3

2

positions de SLC13A3 où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 93,6 kb de SLC13A3, introns compris, et pas seulement les 4 kb d'exons.

Traits associés à SLC13A3

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que SLC13A3 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SLC13A3 : solute carrier family 13 member 3. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/slc13a3

Vancouver

Dante Labs. Gène SLC13A3 : solute carrier family 13 member 3 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/slc13a3

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