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Gène

PHF1

PHD finger protein 1

Résumé

Localisation cytogénétique
6p21.32
Coordonnées
Chromosome 6 : 33 411 014–33 416 439 (GRCh38)
Exons
15 exons sur 5,4 kb
Protéine
567 acides aminés
Aussi appelé
MTF2L2, TDRD19C, PCL1
Transcrit MANE Select
ENST00000374516.8NM_024165.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore PHF1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de PHF1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 6, avec un crochet à l'emplacement de PHF1. PHF1 et 33 gènes à proximité sur le chromosome 6, de 32 913 727 à 33 913 726.Chromosome 66p21.32p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2733 Mb33,2 Mb33,4 Mb33,6 Mb33,8 MbHLA-DMB : 32 929 338–32 941 490, brin inverseHLA-DMB : 32 937 364–32 953 122, brin inverseHLA-DMA : 32 948 613–32 969 094, brin inverseHLA-DMABRD2 : 32 968 564–32 981 505, brin directBRD2HLA-DOA : 33 004 178–33 009 617, brin inverseHLA-DOAHLA-DPA1 : 33 064 569–33 080 781, brin inverseHLA-DPA1HLA-DPB1 : 33 073 786–33 091 655, brin directHLA-DPB1COL11A2 : 33 162 681–33 192 802, brin inverseRXRB : 33 193 585–33 200 693, brin inverseRXRBSLC39A7 : 33 200 305–33 204 439, brin directSLC39A7HSD17B8 : 33 204 631–33 206 831, brin directHSD17B8RING1 : 33 208 033–33 212 722, brin directRING1VPS52 : 33 250 272–33 272 047, brin inverseVPS52RPS18 : 33 271 730–33 276 513, brin directB3GALT4 : 33 277 123–33 284 832, brin directWDR46 : 33 279 103–33 289 523, brin inversePFDN6 : 33 288 680–33 298 441, brin directRGL2 : 33 291 180–33 299 534, brin inverseTAPBP : 33 299 694–33 314 284, brin inverseZBTB22 : 33 314 406–33 318 021, brin inverseZBTB22DAXX : 33 318 558–33 323 259, brin inverseDAXX : 33 321 386–33 329 286, brin inverseSMIM40 : 33 323 628–33 329 279, brin inverseSMIM40KIFC1 : 33 391 429–33 410 441, brin directKIFC1PHF1 : 33 411 014–33 416 439, brin directPHF1CUTA : 33 416 442–33 418 381, brin inverseCUTASYNGAP1 : 33 419 661–33 453 689, brin directSYNGAP1ZBTB9 : 33 453 970–33 457 544, brin directZBTB9BAK1 : 33 568 791–33 580 305, brin inverseBAK1ITPR3 : 33 620 331–33 696 575, brin directITPR3UQCC2 : 33 690 635–33 711 748, brin inverseUQCC2IP6K3 : 33 721 314–33 750 520, brin inverseIP6K3LEMD2 : 33 771 202–33 789 173, brin inverseLEMD2MLN : 33 794 673–33 804 006, brin inverseMLNSchéma de PHF1 : 15 exons sur le brin direct du chromosome 6Exon 1 : 33 411 014–33 411 215, 202 basesExon 2 : 33 412 248–33 412 422, 175 basesExon 3 : 33 412 508–33 412 589, 82 basesExon 4 : 33 412 698–33 412 793, 96 basesExon 5 : 33 413 196–33 413 296, 101 basesExon 6 : 33 413 409–33 413 557, 149 basesExon 7 : 33 413 736–33 413 831, 96 basesExon 8 : 33 414 041–33 414 109, 69 basesExon 9 : 33 414 243–33 414 366, 124 basesExon 10 : 33 414 477–33 414 544, 68 basesExon 11 : 33 414 725–33 414 829, 105 basesExon 12 : 33 414 955–33 415 144, 190 basesExon 13 : 33 415 235–33 415 329, 95 basesExon 14 : 33 415 590–33 415 670, 81 basesExon 15 : 33 415 810–33 416 439, 630 bases1234567891011121314155′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,3 kb sur les 5,4 kb du gène ; 1 704 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène PHF1 : PHD finger protein 1. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/phf1

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Dante Labs. Gène PHF1 : PHD finger protein 1 [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/phf1

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