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Gène

HLA-DOA

major histocompatibility complex, class II, DO alpha

Résumé

Localisation cytogénétique
6p21.32
Coordonnées
Chromosome 6 : 33 004 182–33 009 591 (GRCh38)
Exons
5 exons sur 5,4 kb
Protéine
250 acides aminés
Aussi appelé
HLA-D0-alpha
Symboles précédents
HLA-DZA, HLA-DNA
Transcrit MANE Select
ENST00000229829.7NM_002119.4
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore HLA-DOA. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de HLA-DOA

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 6, avec un crochet à l'emplacement de HLA-DOA. HLA-DOA et 39 gènes à proximité sur le chromosome 6, de 32 506 887 à 33 506 886.Chromosome 66p21.32p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2732,6 Mb32,8 Mb33 Mb33,2 Mb33,4 MbHLA-DRB5 : 32 516 622–32 530 369, brin inverseHLA-DRB5HLA-DRB1 : 32 577 902–32 589 848, brin inverseHLA-DRB1HLA-DQA1 : 32 628 179–32 659 533, brin directHLA-DQA1HLA-DQB1 : 32 640 622–32 668 383, brin inverseHLA-DQB1HLA-DQA2 : 32 741 391–32 747 198, brin directHLA-DQA2HLA-DQB2 : 32 756 094–32 763 563, brin inverseHLA-DQB2HLA-DOB : 32 812 763–32 820 466, brin inverse : 32 813 767–32 838 822, brin inverseTAP2 : 32 821 833–32 838 802, brin inverseTAP2PSMB8 : 32 840 717–32 844 679, brin inversePSMB8PSMB9 : 32 844 136–32 882 881, brin directPSMB9TAP1 : 32 845 204–32 854 026, brin inverseTAP1HLA-DMB : 32 929 338–32 941 490, brin inverseHLA-DMB : 32 937 364–32 953 122, brin inverseHLA-DMA : 32 948 613–32 969 094, brin inverseHLA-DMABRD2 : 32 968 564–32 981 505, brin directBRD2HLA-DOA : 33 004 182–33 009 591, brin inverseHLA-DOAHLA-DPA1 : 33 064 569–33 080 781, brin inverseHLA-DPA1HLA-DPB1 : 33 073 786–33 091 655, brin directHLA-DPB1COL11A2 : 33 162 681–33 192 802, brin inverseCOL11A2RXRB : 33 193 585–33 200 693, brin inverseRXRBSLC39A7 : 33 200 305–33 204 439, brin directSLC39A7HSD17B8 : 33 204 631–33 206 831, brin directHSD17B8RING1 : 33 208 033–33 212 722, brin directVPS52 : 33 250 272–33 272 047, brin inverseVPS52RPS18 : 33 271 730–33 276 513, brin directRPS18B3GALT4 : 33 277 123–33 284 832, brin directB3GALT4WDR46 : 33 279 103–33 289 523, brin inverseWDR46PFDN6 : 33 288 680–33 298 441, brin directRGL2 : 33 291 180–33 299 534, brin inverseTAPBP : 33 299 694–33 314 284, brin inverseZBTB22 : 33 314 406–33 318 021, brin inverseDAXX : 33 318 558–33 323 259, brin inverse : 33 321 386–33 329 286, brin inverseSMIM40 : 33 323 628–33 329 279, brin inverseKIFC1 : 33 391 429–33 410 441, brin directKIFC1PHF1 : 33 410 360–33 416 453, brin directPHF1CUTA : 33 416 442–33 418 381, brin inverseCUTASYNGAP1 : 33 419 661–33 453 689, brin directSYNGAP1ZBTB9 : 33 453 970–33 457 544, brin directZBTB9Schéma de HLA-DOA : 5 exons sur le brin inverse du chromosome 6Exon 5 : 33 004 182–33 006 841, 2 660 basesExon 4 : 33 007 080–33 007 215, 136 basesExon 3 : 33 007 311–33 007 592, 282 basesExon 2 : 33 008 013–33 008 261, 249 basesExon 1 : 33 009 455–33 009 591, 137 bases543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,5 kb sur les 5,4 kb du gène ; 753 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène HLA-DOA : major histocompatibility complex, class II, DO alpha. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/hla-doa

Vancouver

Dante Labs. Gène HLA-DOA : major histocompatibility complex, class II, DO alpha [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/hla-doa

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