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Gène

NLRX1

NLR family member X1

Résumé

Localisation cytogénétique
11q23.3
Coordonnées
Chromosome 11 : 119 168 725–119 184 016 (GRCh38)
Exons
10 exons sur 15,3 kb
Protéine
975 acides aminés
Aussi appelé
NOD9, CLR11.3
Transcrit MANE Select
ENST00000409109.6NM_001282144.2
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

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Structure de NLRX1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 11, avec un crochet à l'emplacement de NLRX1. NLRX1 et 28 gènes à proximité sur le chromosome 11, de 118 676 371 à 119 676 370.Chromosome 1111q23.3p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25118,8 Mb119 Mb119,2 Mb119,4 Mb119,6 MbTREH : 118 657 265–118 679 694, brin inverseTREHDDX6 : 118 747 763–118 791 226, brin inverseDDX6CXCR5 : 118 883 868–118 897 787, brin directCXCR5BCL9L : 118 893 875–118 925 926, brin inverseBCL9LUPK2 : 118 925 164–118 958 559, brin directUPK2FOXR1 : 118 971 623–118 981 287, brin directCENATAC : 118 998 051–119 015 811, brin directRPS25 : 119 014 665–119 018 724, brin inverseRPS25TRAPPC4 : 119 018 733–119 025 454, brin directTRAPPC4SLC37A4 : 119 023 751–119 030 906, brin inverseSLC37A4HYOU1 : 119 044 185–119 057 252, brin inverseHYOU1VPS11 : 119 067 789–119 082 753, brin directHMBS : 119 084 861–119 093 920, brin directH2AX : 119 093 874–119 095 465, brin inverseH2AXDPAGT1 : 119 095 979–119 108 331, brin inverseDPAGT1C2CD2L : 119 102 198–119 118 544, brin directC2CD2LHINFP : 119 121 509–119 136 059, brin directHINFPABCG4 : 119 149 029–119 162 653, brin directABCG4NLRX1 : 119 168 725–119 184 016, brin directNLRX1NHERF4 : 119 185 457–119 190 227, brin directNHERF4DRC12 : 119 190 055–119 206 266, brin inverseDRC12CBL : 119 206 036–119 313 926, brin directCBLMCAM : 119 307 972–119 321 521, brin inverseMCAMRNF26 : 119 334 527–119 337 309, brin directRNF26C1QTNF5 : 119 338 942–119 340 940, brin inverseC1QTNF5MFRP : 119 338 942–119 346 705, brin inverseMFRPUSP2 : 119 355 215–119 381 720, brin inverseUSP2THY1 : 119 415 476–119 424 985, brin inverseTHY1NECTIN1 : 119 623 408–119 729 488, brin inverseNECTIN1Schéma de NLRX1 : 10 exons sur le brin direct du chromosome 11Exon 1 : 119 168 725–119 169 302, 578 basesExon 2 : 119 171 356–119 171 473, 118 basesExon 3 : 119 172 356–119 172 425, 70 basesExon 4 : 119 172 901–119 172 989, 89 basesExon 5 : 119 173 479–119 174 098, 620 basesExon 6 : 119 174 453–119 175 274, 822 basesExon 7 : 119 179 693–119 180 288, 596 basesExon 8 : 119 181 171–119 181 257, 87 basesExon 9 : 119 182 094–119 182 345, 252 basesExon 10 : 119 183 118–119 184 016, 899 bases123456789105′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,1 kb sur les 15,3 kb du gène ; 2 928 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène NLRX1 : NLR family member X1. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/nlrx1

Vancouver

Dante Labs. Gène NLRX1 : NLR family member X1 [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/nlrx1

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