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Gène

IGSF3

immunoglobulin superfamily member 3

Résumé

Localisation cytogénétique
1p13.1
Coordonnées
Chromosome 1 : 116 574 408–116 667 733 (GRCh38)
Exons
11 exons sur 93,3 kb
Protéine
1 194 acides aminés
Aussi appelé
V8, EWI-3, MGC117164
Transcrit MANE Select
ENST00000369486.8NM_001007237.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore IGSF3. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de IGSF3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de IGSF3. IGSF3 et 8 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 116 121 071 à 117 121 070.Chromosome 11p13.1p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44116,2 Mb116,4 Mb116,6 Mb116,8 Mb117 MbMAB21L3 : 116 111 068–116 138 149, brin directMAB21L3ATP1A1 : 116 372 668–116 410 261, brin directATP1A1CD58 : 116 499 485–116 571 061, brin inverseCD58IGSF3 : 116 574 408–116 667 733, brin inverseIGSF3CD2 : 116 754 370–116 769 229, brin directCD2PTGFRN : 116 909 870–116 990 358, brin directPTGFRNCD101 : 117 001 721–117 036 552, brin directCD101TTF2 : 117 060 285–117 107 453, brin directTTF2TRIM45 : 117 111 060–117 122 587, brin inverseTRIM45Schéma de IGSF3 : 11 exons sur le brin inverse du chromosome 1Exon 7 : 1 site connu associé à une maladieExon 11 : 116 574 408–116 577 562, 3 155 basesExon 10 : 116 579 392–116 579 877, 486 basesExon 9 : 116 584 645–116 585 052, 408 basesExon 8 : 116 588 694–116 589 104, 411 basesExon 7 : 116 599 941–116 600 345, 405 basesExon 6 : 116 603 624–116 604 025, 402 basesExon 5 : 116 607 942–116 608 331, 390 basesExon 4 : 116 613 765–116 614 175, 411 basesExon 3 : 116 616 080–116 616 457, 378 basesExon 2 : 116 666 284–116 666 956, 673 basesExon 1 : 116 667 618–116 667 733, 116 bases1110515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 7,2 kb sur les 93,3 kb du gène ; 3 585 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit IGSF3

1

position dans IGSF3 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

1 d'entre elles (100 %) se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

  • Low mappability (1 site)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (1 site)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Un génome entier couvre les 93,3 kb de IGSF3, introns compris, et pas seulement les 7,2 kb d'exons.

Traits associés à IGSF3

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que IGSF3 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène IGSF3 : immunoglobulin superfamily member 3. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/igsf3

Vancouver

Dante Labs. Gène IGSF3 : immunoglobulin superfamily member 3 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/igsf3

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