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Gène

ATG2A

autophagy related 2A

Résumé

Localisation cytogénétique
11q13.1
Coordonnées
Chromosome 11 : 64 894 546–64 917 209 (GRCh38)
Exons
41 exons sur 22,7 kb
Protéine
1 938 acides aminés
Aussi appelé
KIAA0404, BLTP4A
Transcrit MANE Select
ENST00000377264.8NM_015104.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

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Structure de ATG2A

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 11, avec un crochet à l'emplacement de ATG2A. ATG2A et 37 gènes à proximité sur le chromosome 11, de 64 405 878 à 65 405 877.Chromosome 1111q13.1p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2564,6 Mb64,8 Mb65 Mb65,2 Mb65,4 MbSLC22A11 : 64 555 632–64 572 875, brin directSLC22A11SLC22A12 : 64 590 641–64 602 353, brin directSLC22A12NRXN2 : 64 606 174–64 723 202, brin inverseNRXN2RASGRP2 : 64 726 905–64 745 456, brin inverseRASGRP2PYGM : 64 746 389–64 759 990, brin inversePYGMSF1 : 64 764 605–64 778 802, brin inverseSF1MAP4K2 : 64 784 918–64 803 245, brin inverseMAP4K2MEN1 : 64 803 500–64 811 294, brin inverseMEN1CDC42BPG : 64 823 051–64 844 735, brin inverseCDC42BPGEHD1 : 64 851 642–64 888 372, brin inverseEHD1ATG2A : 64 894 546–64 917 209, brin inverseATG2APPP2R5B : 64 917 553–64 934 480, brin directPPP2R5BGPHA2 : 64 934 471–64 935 894, brin inverseGPHA2MAJIN : 64 937 517–64 972 113, brin inverseMAJINBATF2 : 64 987 945–64 997 018, brin inverseBATF2ARL2 : 65 013 735–65 024 328, brin directARL2ARL2-SNX15 : 65 014 182–65 040 570, brin directARL2-SNX15SNX15 : 65 027 404–65 040 578, brin directSNX15SAC3D1 : 65 040 897–65 047 320, brin directNAALADL1 : 65 044 818–65 058 558, brin inverseCDCA5 : 65 066 299–65 084 164, brin inverseZFPL1 : 65 084 210–65 088 409, brin directZFPL1CATSPERH : 65 084 974–65 089 375, brin inverseVPS51 : 65 089 324–65 111 862, brin directVPS51TM7SF2 : 65 111 845–65 116 677, brin directTM7SF2ZNHIT2 : 65 116 403–65 117 701, brin inverseFAU : 65 120 182–65 122 221, brin inverseSYVN1 : 65 121 780–65 146 912, brin inverseMRPL49 : 65 122 183–65 127 371, brin directSPDYC : 65 166 137–65 173 380, brin directSPDYCCAPN1 : 65 180 566–65 212 006, brin directCAPN1POLA2 : 65 261 835–65 305 959, brin directPOLA2 : 65 261 928–65 326 543, brin directCDC42EP2 : 65 298 955–65 322 662, brin directCDC42EP2DPF2 : 65 333 792–65 354 262, brin directDPF2TIGD3 : 65 354 746–65 357 613, brin directTIGD3SLC25A45 : 65 375 186–65 384 550, brin inverseSLC25A45FRMD8 : 65 386 592–65 413 526, brin directFRMD8Schéma de ATG2A : 41 exons sur le brin inverse du chromosome 11Exon 41 : 64 894 546–64 895 209, 664 basesExon 40 : 64 895 290–64 895 442, 153 basesExon 39 : 64 896 462–64 896 616, 155 basesExon 38 : 64 896 748–64 896 869, 122 basesExon 37 : 64 897 412–64 897 494, 83 basesExon 36 : 64 897 671–64 897 743, 73 basesExon 35 : 64 897 839–64 897 974, 136 basesExon 34 : 64 898 086–64 898 170, 85 basesExon 33 : 64 898 261–64 898 362, 102 basesExon 32 : 64 898 636–64 898 842, 207 basesExon 31 : 64 900 494–64 900 629, 136 basesExon 30 : 64 900 884–64 901 092, 209 basesExon 29 : 64 901 962–64 902 176, 215 basesExon 28 : 64 902 260–64 902 386, 127 basesExon 27 : 64 902 516–64 902 680, 165 basesExon 26 : 64 903 288–64 903 364, 77 basesExon 25 : 64 903 590–64 903 660, 71 basesExon 24 : 64 905 563–64 905 655, 93 basesExon 23 : 64 905 742–64 905 848, 107 basesExon 22 : 64 906 113–64 906 193, 81 basesExon 21 : 64 906 334–64 906 533, 200 basesExon 20 : 64 906 665–64 906 815, 151 basesExon 19 : 64 907 255–64 907 439, 185 basesExon 18 : 64 907 525–64 907 664, 140 basesExon 17 : 64 907 748–64 907 890, 143 basesExon 16 : 64 908 991–64 909 150, 160 basesExon 15 : 64 909 271–64 909 367, 97 basesExon 14 : 64 909 681–64 909 924, 244 basesExon 13 : 64 910 040–64 910 195, 156 basesExon 12 : 64 910 616–64 910 708, 93 basesExon 11 : 64 910 807–64 910 954, 148 basesExon 10 : 64 911 038–64 911 275, 238 basesExon 9 : 64 911 842–64 911 982, 141 basesExon 8 : 64 912 085–64 912 249, 165 basesExon 7 : 64 912 327–64 912 423, 97 basesExon 6 : 64 913 038–64 913 136, 99 basesExon 5 : 64 913 266–64 913 401, 136 basesExon 4 : 64 913 821–64 913 923, 103 basesExon 3 : 64 914 081–64 914 233, 153 basesExon 2 : 64 914 338–64 914 500, 163 basesExon 1 : 64 916 965–64 917 209, 245 bases412515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 6,3 kb sur les 22,7 kb du gène ; 5 817 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène ATG2A : autophagy related 2A. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/atg2a

Vancouver

Dante Labs. Gène ATG2A : autophagy related 2A [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/atg2a

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