Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

SLC31A1

solute carrier family 31 member 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
9q32
Koordinaatit
Kromosomi 9: 113 221 544–113 264 492 (GRCh38)
Eksonit
5 eksonia 42,9 kb:n alueella
Proteiini
190 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
hCTR1, CTR1
Aiemmat symbolit
COPT1
MANE Select -transkripti
ENST00000374212.5NM_001859.4
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä SLC31A1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

SLC31A1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 9, jossa hakasulke osoittaa SLC31A1-geenin sijainnin. SLC31A1 ja 16 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 9, välillä 112 743 018–113 743 017.Kromosomi 99q32p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.3112,8 Mb113 Mb113,2 Mb113,4 Mb113,6 MbSNX30: 112 750 724–112 881 671, juoste eteenpäinSNX30SLC46A2: 112 878 920–112 890 919, juoste taaksepäinSLC46A2ZNF883: 112 988 129–113 012 242, juoste taaksepäinZNF883ZFP37: 113 038 377–113 056 802, juoste taaksepäinZFP37SLC31A2: 113 150 951–113 164 140, juoste eteenpäinSLC31A2FKBP15: 113 161 006–113 221 458, juoste taaksepäinFKBP15SLC31A1: 113 221 544–113 264 492, juoste eteenpäinSLC31A1CDC26: 113 223 011–113 275 602, juoste taaksepäinCDC26PRPF4: 113 275 637–113 295 342, juoste eteenpäinPRPF4RNF183: 113 297 093–113 303 376, juoste taaksepäinRNF183WDR31: 113 313 222–113 340 337, juoste taaksepäinWDR31BSPRY: 113 349 515–113 371 233, juoste eteenpäinBSPRYHDHD3: 113 373 215–113 377 473, juoste taaksepäinHDHD3ALAD: 113 386 304–113 401 356, juoste taaksepäinALADPOLE3: 113 407 232–113 410 723, juoste taaksepäinPOLE3C9orf43: 113 410 054–113 429 690, juoste eteenpäinRGS3: 113 444 731–113 597 743, juoste eteenpäinRGS3SLC31A1-kaavio: 5 eksonia kromosomin 9 juosteella, eteenpäinEkson 1: 113 221 544–113 221 678, 135 emästäEkson 2: 113 256 114–113 256 277, 164 emästäEkson 3: 113 257 113–113 257 185, 73 emästäEkson 4: 113 258 694–113 258 862, 169 emästäEkson 5: 113 260 272–113 264 492, 4 221 emästä123455′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 4,8 kb geenin 42,9 kb:stä; 573 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Sekvensointi: SLC31A1

29Kohtalainen

Kuinka vaikea SLC31A1 on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

  • Kartoitettavuus4,9 %
  • Homologia89 %
  • Toistot2,7 %
  • GC-pitoisuus2 %
  • Referenssin peittävyys0 %

Geeniin SLC31A1 liittyvät piirteet

Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita SLC31A1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.
  • Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). SLC31A1-geeni: solute carrier family 31 member 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/slc31a1

Vancouver

Dante Labs. SLC31A1-geeni: solute carrier family 31 member 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/slc31a1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test