Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

VPS39

VPS39 subunit of HOPS complex

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
15q15.1
Koordinaadid
Kromosoom 15: 42 158 701–42 208 304 (GRCh38)
Eksonid
25 eksonit, ulatus 49,6 kb
Valk
875 aminohapet
Tuntud ka kui
KIAA0770, VAM6
MANE Select transkript
ENST00000318006.10NM_015289.5
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni VPS39 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas VPS39 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 15, millel on sulg kohal, kus asub VPS39. VPS39 ja sellele lähedal asuvad 20 geeni kromosoomil 15, vahemikus 41 683 503 kuni 42 683 502.Kromosoom 1515q15.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.341,8 Mb42 Mb42,2 Mb42,4 Mb42,6 MbMGA: 41 621 134–41 773 081, otsene ahelMGAMAPKBP1: 41 774 434–41 827 855, otsene ahelMAPKBP1JMJD7: 41 828 067–41 837 589, otsene ahelJMJD7JMJD7-PLA2G4B: 41 828 095–41 848 155, otsene ahelJMJD7-PLA2G4BPLA2G4B: 41 837 775–41 848 147, otsene ahelPLA2G4BSPTBN5: 41 848 146–41 894 053, pöördne ahelSPTBN5EHD4: 41 895 928–41 972 614, pöördne ahelEHD4PLA2G4E: 41 981 394–42 051 190, pöördne ahelPLA2G4EPLA2G4D: 42 067 009–42 094 565, pöördne ahelPLA2G4DPLA2G4F: 42 139 034–42 156 659, pöördne ahelPLA2G4FVPS39: 42 158 701–42 208 304, pöördne ahelVPS39TMEM87A: 42 209 667–42 274 128, pöördne ahelTMEM87AGANC: 42 273 196–42 353 666, otsene ahelGANC: 42 348 103–42 412 317, otsene ahelCAPN3: 42 359 494–42 412 949, otsene ahelCAPN3ZNF106: 42 412 823–42 491 150, pöördne ahelZNF106SNAP23: 42 491 233–42 545 358, otsene ahelSNAP23: 42 497 395–42 548 786, pöördne ahelLRRC57: 42 534 627–42 548 802, pöördne ahelLRRC57HAUS2: 42 548 828–42 572 263, otsene ahelHAUS2STARD9: 42 575 574–42 720 998, otsene ahelSTARD9VPS39 skeem: 25 eksonit kromosoomi 15 pöördne ahelalEkson 25: 42 158 701–42 160 829, 2129 alustEkson 24: 42 161 682–42 161 773, 92 alustEkson 23: 42 162 032–42 162 166, 135 alustEkson 22: 42 162 332–42 162 481, 150 alustEkson 21: 42 163 350–42 163 395, 46 alustEkson 20: 42 163 626–42 163 728, 103 alustEkson 19: 42 164 358–42 164 486, 129 alustEkson 18: 42 164 996–42 165 113, 118 alustEkson 17: 42 165 718–42 165 816, 99 alustEkson 16: 42 166 159–42 166 232, 74 alustEkson 15: 42 166 563–42 166 649, 87 alustEkson 14: 42 166 772–42 166 913, 142 alustEkson 13: 42 167 394–42 167 537, 144 alustEkson 12: 42 169 724–42 169 866, 143 alustEkson 11: 42 173 723–42 173 852, 130 alustEkson 10: 42 178 218–42 178 338, 121 alustEkson 9: 42 178 450–42 178 570, 121 alustEkson 8: 42 184 517–42 184 700, 184 alustEkson 7: 42 187 271–42 187 363, 93 alustEkson 6: 42 187 758–42 187 856, 99 alustEkson 5: 42 189 114–42 189 208, 95 alustEkson 4: 42 191 125–42 191 167, 43 alustEkson 3: 42 191 496–42 191 560, 65 alustEkson 2: 42 199 896–42 199 961, 66 alustEkson 1: 42 208 081–42 208 304, 224 alust25201510515′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 4,8 kb kogupikkusega 49,6 kb; neist 2628 alust kodeerivad valku.

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). VPS39 geen: VPS39 subunit of HOPS complex. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/vps39

Vancouver

Dante Labs. VPS39 geen: VPS39 subunit of HOPS complex [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/vps39

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test