Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi

Geeni

VPS39

VPS39 subunit of HOPS complex

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
15q15.1
Koordinaatit
Kromosomi 15: 42 158 701–42 208 304 (GRCh38)
Eksonit
25 eksonia 49,6 kb:n alueella
Proteiini
875 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
KIAA0770, VAM6
MANE Select -transkripti
ENST00000318006.10NM_015289.5
Lokustyyppi
gene with protein product
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

ViitegenomiGRCh38

Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä VPS39. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

VPS39-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 15, jossa hakasulke osoittaa VPS39-geenin sijainnin. VPS39 ja 20 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 15, välillä 41 683 503–42 683 502.Kromosomi 1515q15.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.341,8 Mb42 Mb42,2 Mb42,4 Mb42,6 MbMGA: 41 621 134–41 773 081, juoste eteenpäinMGAMAPKBP1: 41 774 434–41 827 855, juoste eteenpäinMAPKBP1JMJD7: 41 828 067–41 837 589, juoste eteenpäinJMJD7JMJD7-PLA2G4B: 41 828 095–41 848 155, juoste eteenpäinJMJD7-PLA2G4BPLA2G4B: 41 837 775–41 848 147, juoste eteenpäinPLA2G4BSPTBN5: 41 848 146–41 894 053, juoste taaksepäinSPTBN5EHD4: 41 895 928–41 972 614, juoste taaksepäinEHD4PLA2G4E: 41 981 394–42 051 190, juoste taaksepäinPLA2G4EPLA2G4D: 42 067 009–42 094 565, juoste taaksepäinPLA2G4DPLA2G4F: 42 139 034–42 156 659, juoste taaksepäinPLA2G4FVPS39: 42 158 701–42 208 304, juoste taaksepäinVPS39TMEM87A: 42 209 667–42 274 128, juoste taaksepäinTMEM87AGANC: 42 273 196–42 353 666, juoste eteenpäinGANC: 42 348 103–42 412 317, juoste eteenpäinCAPN3: 42 359 494–42 412 949, juoste eteenpäinCAPN3ZNF106: 42 412 823–42 491 150, juoste taaksepäinZNF106SNAP23: 42 491 233–42 545 358, juoste eteenpäinSNAP23: 42 497 395–42 548 786, juoste taaksepäinLRRC57: 42 534 627–42 548 802, juoste taaksepäinLRRC57HAUS2: 42 548 828–42 572 263, juoste eteenpäinHAUS2STARD9: 42 575 574–42 720 998, juoste eteenpäinSTARD9VPS39-kaavio: 25 eksonia kromosomin 15 juosteella, taaksepäinEkson 25: 42 158 701–42 160 829, 2 129 emästäEkson 24: 42 161 682–42 161 773, 92 emästäEkson 23: 42 162 032–42 162 166, 135 emästäEkson 22: 42 162 332–42 162 481, 150 emästäEkson 21: 42 163 350–42 163 395, 46 emästäEkson 20: 42 163 626–42 163 728, 103 emästäEkson 19: 42 164 358–42 164 486, 129 emästäEkson 18: 42 164 996–42 165 113, 118 emästäEkson 17: 42 165 718–42 165 816, 99 emästäEkson 16: 42 166 159–42 166 232, 74 emästäEkson 15: 42 166 563–42 166 649, 87 emästäEkson 14: 42 166 772–42 166 913, 142 emästäEkson 13: 42 167 394–42 167 537, 144 emästäEkson 12: 42 169 724–42 169 866, 143 emästäEkson 11: 42 173 723–42 173 852, 130 emästäEkson 10: 42 178 218–42 178 338, 121 emästäEkson 9: 42 178 450–42 178 570, 121 emästäEkson 8: 42 184 517–42 184 700, 184 emästäEkson 7: 42 187 271–42 187 363, 93 emästäEkson 6: 42 187 758–42 187 856, 99 emästäEkson 5: 42 189 114–42 189 208, 95 emästäEkson 4: 42 191 125–42 191 167, 43 emästäEkson 3: 42 191 496–42 191 560, 65 emästäEkson 2: 42 199 896–42 199 961, 66 emästäEkson 1: 42 208 081–42 208 304, 224 emästä25201510515′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 4,8 kb geenin 49,6 kb:stä; 2 628 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). VPS39-geeni: VPS39 subunit of HOPS complex. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/vps39

Vancouver

Dante Labs. VPS39-geeni: VPS39 subunit of HOPS complex [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/vps39

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test