Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét

Gén

VPS39

VPS39 subunit of HOPS complex

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
15q15.1
Koordináták
15. kromoszóma: 42 158 701–42 208 304 (GRCh38)
Exonok
25 exon, összesen 49,6 kb
Fehérje
875 aminosav
Más néven ismert
KIAA0770, VAM6
MANE Select transzkriptum
ENST00000318006.10NM_015289.5
Lokusz típusa
gene with protein product
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Referencia genomGRCh38

A gén- és variánsoldalakon a pozíciók ennek a választásnak megfelelően jelennek meg, ebben a böngészőben.

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) VPS39 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A VPS39 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
15. kromoszóma, a VPS39 helyét zárójel jelöli. A VPS39 és környékén 20 gén a 15. kromoszómán, 41 683 503–42 683 502 között.15. kromoszóma15q15.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.341,8 Mb42 Mb42,2 Mb42,4 Mb42,6 MbMGA: 41 621 134–41 773 081, előre szálMGAMAPKBP1: 41 774 434–41 827 855, előre szálMAPKBP1JMJD7: 41 828 067–41 837 589, előre szálJMJD7JMJD7-PLA2G4B: 41 828 095–41 848 155, előre szálJMJD7-PLA2G4BPLA2G4B: 41 837 775–41 848 147, előre szálPLA2G4BSPTBN5: 41 848 146–41 894 053, fordított szálSPTBN5EHD4: 41 895 928–41 972 614, fordított szálEHD4PLA2G4E: 41 981 394–42 051 190, fordított szálPLA2G4EPLA2G4D: 42 067 009–42 094 565, fordított szálPLA2G4DPLA2G4F: 42 139 034–42 156 659, fordított szálPLA2G4FVPS39: 42 158 701–42 208 304, fordított szálVPS39TMEM87A: 42 209 667–42 274 128, fordított szálTMEM87AGANC: 42 273 196–42 353 666, előre szálGANC: 42 348 103–42 412 317, előre szálCAPN3: 42 359 494–42 412 949, előre szálCAPN3ZNF106: 42 412 823–42 491 150, fordított szálZNF106SNAP23: 42 491 233–42 545 358, előre szálSNAP23: 42 497 395–42 548 786, fordított szálLRRC57: 42 534 627–42 548 802, fordított szálLRRC57HAUS2: 42 548 828–42 572 263, előre szálHAUS2STARD9: 42 575 574–42 720 998, előre szálSTARD9A VPS39 ábrája: 25 exon a(z) 15. kromoszóma fordított szálán25. exon: 42 158 701–42 160 829, 2129 bázis24. exon: 42 161 682–42 161 773, 92 bázis23. exon: 42 162 032–42 162 166, 135 bázis22. exon: 42 162 332–42 162 481, 150 bázis21. exon: 42 163 350–42 163 395, 46 bázis20. exon: 42 163 626–42 163 728, 103 bázis19. exon: 42 164 358–42 164 486, 129 bázis18. exon: 42 164 996–42 165 113, 118 bázis17. exon: 42 165 718–42 165 816, 99 bázis16. exon: 42 166 159–42 166 232, 74 bázis15. exon: 42 166 563–42 166 649, 87 bázis14. exon: 42 166 772–42 166 913, 142 bázis13. exon: 42 167 394–42 167 537, 144 bázis12. exon: 42 169 724–42 169 866, 143 bázis11. exon: 42 173 723–42 173 852, 130 bázis10. exon: 42 178 218–42 178 338, 121 bázis9. exon: 42 178 450–42 178 570, 121 bázis8. exon: 42 184 517–42 184 700, 184 bázis7. exon: 42 187 271–42 187 363, 93 bázis6. exon: 42 187 758–42 187 856, 99 bázis5. exon: 42 189 114–42 189 208, 95 bázis4. exon: 42 191 125–42 191 167, 43 bázis3. exon: 42 191 496–42 191 560, 65 bázis2. exon: 42 199 896–42 199 961, 66 bázis1. exon: 42 208 081–42 208 304, 224 bázis25201510515′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 49,6 kb-jából 4,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2628 bázis kódolja a fehérjét.

Honnan származnak az adatok

  • HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). VPS39 gén: VPS39 subunit of HOPS complex. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/vps39

Vancouver

Dante Labs. VPS39 gén: VPS39 subunit of HOPS complex [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/vps39

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet