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Gene

VPS39

VPS39 subunit of HOPS complex

Sintesi

Localizzazione citogenetica
15q15.1
Coordinate
Cromosoma 15: 42.158.701–42.208.304 (GRCh38)
Esoni
25 esoni su 49,6 kb
Proteina
875 amminoacidi
Noto anche come
KIAA0770, VAM6
Trascritto MANE Select
ENST00000318006.10NM_015289.5
Tipo di locus
gene with protein product

Genoma di riferimentoGRCh38

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Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora VPS39. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di VPS39

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 15, con una parentesi dove si trova VPS39. VPS39 e 20 geni nelle vicinanze sul cromosoma 15, da 41.683.503 a 42.683.502.Cromosoma 1515q15.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.341,8 Mb42 Mb42,2 Mb42,4 Mb42,6 MbMGA: 41.621.134–41.773.081, filamento direttoMGAMAPKBP1: 41.774.434–41.827.855, filamento direttoMAPKBP1JMJD7: 41.828.067–41.837.589, filamento direttoJMJD7JMJD7-PLA2G4B: 41.828.095–41.848.155, filamento direttoJMJD7-PLA2G4BPLA2G4B: 41.837.775–41.848.147, filamento direttoPLA2G4BSPTBN5: 41.848.146–41.894.053, filamento inversoSPTBN5EHD4: 41.895.928–41.972.614, filamento inversoEHD4PLA2G4E: 41.981.394–42.051.190, filamento inversoPLA2G4EPLA2G4D: 42.067.009–42.094.565, filamento inversoPLA2G4DPLA2G4F: 42.139.034–42.156.659, filamento inversoPLA2G4FVPS39: 42.158.701–42.208.304, filamento inversoVPS39TMEM87A: 42.209.667–42.274.128, filamento inversoTMEM87AGANC: 42.273.196–42.353.666, filamento direttoGANC: 42.348.103–42.412.317, filamento direttoCAPN3: 42.359.494–42.412.949, filamento direttoCAPN3ZNF106: 42.412.823–42.491.150, filamento inversoZNF106SNAP23: 42.491.233–42.545.358, filamento direttoSNAP23: 42.497.395–42.548.786, filamento inversoLRRC57: 42.534.627–42.548.802, filamento inversoLRRC57HAUS2: 42.548.828–42.572.263, filamento direttoHAUS2STARD9: 42.575.574–42.720.998, filamento direttoSTARD9Diagramma di VPS39: 25 esoni sul filamento inverso del cromosoma 15Esone 25: 42.158.701–42.160.829, 2129 basiEsone 24: 42.161.682–42.161.773, 92 basiEsone 23: 42.162.032–42.162.166, 135 basiEsone 22: 42.162.332–42.162.481, 150 basiEsone 21: 42.163.350–42.163.395, 46 basiEsone 20: 42.163.626–42.163.728, 103 basiEsone 19: 42.164.358–42.164.486, 129 basiEsone 18: 42.164.996–42.165.113, 118 basiEsone 17: 42.165.718–42.165.816, 99 basiEsone 16: 42.166.159–42.166.232, 74 basiEsone 15: 42.166.563–42.166.649, 87 basiEsone 14: 42.166.772–42.166.913, 142 basiEsone 13: 42.167.394–42.167.537, 144 basiEsone 12: 42.169.724–42.169.866, 143 basiEsone 11: 42.173.723–42.173.852, 130 basiEsone 10: 42.178.218–42.178.338, 121 basiEsone 9: 42.178.450–42.178.570, 121 basiEsone 8: 42.184.517–42.184.700, 184 basiEsone 7: 42.187.271–42.187.363, 93 basiEsone 6: 42.187.758–42.187.856, 99 basiEsone 5: 42.189.114–42.189.208, 95 basiEsone 4: 42.191.125–42.191.167, 43 basiEsone 3: 42.191.496–42.191.560, 65 basiEsone 2: 42.199.896–42.199.961, 66 basiEsone 1: 42.208.081–42.208.304, 224 basi25201510515′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 4,8 kb dei 49,6 kb del gene; 2628 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

Cita questa pagina

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Dante Labs. (s.d.). Gene VPS39: VPS39 subunit of HOPS complex. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/vps39

Vancouver

Dante Labs. Gene VPS39: VPS39 subunit of HOPS complex [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/vps39

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