Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

SHMT1

serine hydroxymethyltransferase 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
17p11.2
Koordinaadid
Kromosoom 17: 18 327 873–18 363 550 (GRCh38)
Eksonid
12 eksonit, ulatus 35,7 kb
Valk
483 aminohapet
Tuntud ka kui
cSHMT, SHMT, MGC15229, MGC24556
MANE Select transkript
ENST00000316694.8NM_004169.5
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SHMT1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SHMT1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 17, millel on sulg kohal, kus asub SHMT1. SHMT1 ja sellele lähedal asuvad 19 geeni kromosoomil 17, vahemikus 17 845 712 kuni 18 845 711.Kromosoom 1717p11.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.318 Mb18,2 Mb18,4 Mb18,6 Mb18,8 MbTOM1L2: 17 843 507–17 972 470, pöördne ahelTOM1L2DRC3: 17 972 813–18 016 889, otsene ahelDRC3ATPAF2: 17 977 409–18 040 833, pöördne ahelATPAF2GID4: 18 039 371–18 068 405, otsene ahelGID4DRG2: 18 087 876–18 107 979, otsene ahelDRG2MYO15A: 18 108 756–18 179 802, otsene ahelMYO15AALKBH5: 18 183 034–18 209 954, otsene ahelALKBH5LLGL1: 18 225 542–18 244 876, otsene ahelLLGL1FLII: 18 244 782–18 260 420, pöördne ahelFLIIMIEF2: 18 259 527–18 266 552, otsene ahelMIEF2TOP3A: 18 271 428–18 315 025, pöördne ahelTOP3ASMCR8: 18 315 293–18 328 056, otsene ahelSMCR8SHMT1: 18 327 873–18 363 550, pöördne ahelSHMT1EVPLL: 18 377 674–18 389 652, otsene ahelEVPLLLGALS9C: 18 476 737–18 494 945, otsene ahelLGALS9CTBC1D28: 18 634 247–18 644 427, pöördne ahelTBC1D28FOXO3B: 18 667 629–18 682 314, pöördne ahelFOXO3BFBXW10: 18 744 026–18 779 349, otsene ahelFBXW10TVP23B: 18 781 111–18 806 772, otsene ahelTVP23BPRPSAP2: 18 840 085–18 931 287, otsene ahelPRPSAP2SHMT1 skeem: 12 eksonit kromosoomi 17 pöördne ahelalEkson 12: 18 327 873–18 328 919, 1047 alustEkson 11: 18 329 278–18 329 388, 111 alustEkson 10: 18 330 555–18 330 671, 117 alustEkson 9: 18 333 166–18 333 288, 123 alustEkson 8: 18 335 559–18 335 675, 117 alustEkson 7: 18 340 043–18 340 255, 213 alustEkson 6: 18 340 732–18 340 813, 82 alustEkson 5: 18 347 496–18 347 656, 161 alustEkson 4: 18 348 325–18 348 440, 116 alustEkson 3: 18 353 672–18 353 817, 146 alustEkson 2: 18 355 886–18 356 000, 115 alustEkson 1: 18 363 372–18 363 550, 179 alust1211109876543215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,5 kb kogupikkusega 35,7 kb; neist 1452 alust kodeerivad valku.

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SHMT1 geen: serine hydroxymethyltransferase 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/shmt1

Vancouver

Dante Labs. SHMT1 geen: serine hydroxymethyltransferase 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/shmt1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test