Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi

Geeni

SHMT1

serine hydroxymethyltransferase 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
17p11.2
Koordinaatit
Kromosomi 17: 18 327 873–18 363 550 (GRCh38)
Eksonit
12 eksonia 35,7 kb:n alueella
Proteiini
483 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
cSHMT, SHMT, MGC15229, MGC24556
MANE Select -transkripti
ENST00000316694.8NM_004169.5
Lokustyyppi
gene with protein product
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

ViitegenomiGRCh38

Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä SHMT1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

SHMT1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 17, jossa hakasulke osoittaa SHMT1-geenin sijainnin. SHMT1 ja 19 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 17, välillä 17 845 712–18 845 711.Kromosomi 1717p11.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.318 Mb18,2 Mb18,4 Mb18,6 Mb18,8 MbTOM1L2: 17 843 507–17 972 470, juoste taaksepäinTOM1L2DRC3: 17 972 813–18 016 889, juoste eteenpäinDRC3ATPAF2: 17 977 409–18 040 833, juoste taaksepäinATPAF2GID4: 18 039 371–18 068 405, juoste eteenpäinGID4DRG2: 18 087 876–18 107 979, juoste eteenpäinDRG2MYO15A: 18 108 756–18 179 802, juoste eteenpäinMYO15AALKBH5: 18 183 034–18 209 954, juoste eteenpäinALKBH5LLGL1: 18 225 542–18 244 876, juoste eteenpäinLLGL1FLII: 18 244 782–18 260 420, juoste taaksepäinFLIIMIEF2: 18 259 527–18 266 552, juoste eteenpäinMIEF2TOP3A: 18 271 428–18 315 025, juoste taaksepäinTOP3ASMCR8: 18 315 293–18 328 056, juoste eteenpäinSMCR8SHMT1: 18 327 873–18 363 550, juoste taaksepäinSHMT1EVPLL: 18 377 674–18 389 652, juoste eteenpäinEVPLLLGALS9C: 18 476 737–18 494 945, juoste eteenpäinLGALS9CTBC1D28: 18 634 247–18 644 427, juoste taaksepäinTBC1D28FOXO3B: 18 667 629–18 682 314, juoste taaksepäinFOXO3BFBXW10: 18 744 026–18 779 349, juoste eteenpäinFBXW10TVP23B: 18 781 111–18 806 772, juoste eteenpäinTVP23BPRPSAP2: 18 840 085–18 931 287, juoste eteenpäinPRPSAP2SHMT1-kaavio: 12 eksonia kromosomin 17 juosteella, taaksepäinEkson 12: 18 327 873–18 328 919, 1 047 emästäEkson 11: 18 329 278–18 329 388, 111 emästäEkson 10: 18 330 555–18 330 671, 117 emästäEkson 9: 18 333 166–18 333 288, 123 emästäEkson 8: 18 335 559–18 335 675, 117 emästäEkson 7: 18 340 043–18 340 255, 213 emästäEkson 6: 18 340 732–18 340 813, 82 emästäEkson 5: 18 347 496–18 347 656, 161 emästäEkson 4: 18 348 325–18 348 440, 116 emästäEkson 3: 18 353 672–18 353 817, 146 emästäEkson 2: 18 355 886–18 356 000, 115 emästäEkson 1: 18 363 372–18 363 550, 179 emästä1211109876543215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 2,5 kb geenin 35,7 kb:stä; 1 452 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). SHMT1-geeni: serine hydroxymethyltransferase 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/shmt1

Vancouver

Dante Labs. SHMT1-geeni: serine hydroxymethyltransferase 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/shmt1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test