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Gène

SHMT1

serine hydroxymethyltransferase 1

Résumé

Localisation cytogénétique
17p11.2
Coordonnées
Chromosome 17 : 18 327 873–18 363 550 (GRCh38)
Exons
12 exons sur 35,7 kb
Protéine
483 acides aminés
Aussi appelé
cSHMT, SHMT, MGC15229, MGC24556
Transcrit MANE Select
ENST00000316694.8NM_004169.5
Type de locus
gene with protein product

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SHMT1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SHMT1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 17, avec un crochet à l'emplacement de SHMT1. SHMT1 et 19 gènes à proximité sur le chromosome 17, de 17 845 712 à 18 845 711.Chromosome 1717p11.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.318 Mb18,2 Mb18,4 Mb18,6 Mb18,8 MbTOM1L2 : 17 843 507–17 972 470, brin inverseTOM1L2DRC3 : 17 972 813–18 016 889, brin directDRC3ATPAF2 : 17 977 409–18 040 833, brin inverseATPAF2GID4 : 18 039 371–18 068 405, brin directGID4DRG2 : 18 087 876–18 107 979, brin directDRG2MYO15A : 18 108 756–18 179 802, brin directMYO15AALKBH5 : 18 183 034–18 209 954, brin directALKBH5LLGL1 : 18 225 542–18 244 876, brin directLLGL1FLII : 18 244 782–18 260 420, brin inverseFLIIMIEF2 : 18 259 527–18 266 552, brin directMIEF2TOP3A : 18 271 428–18 315 025, brin inverseTOP3ASMCR8 : 18 315 293–18 328 056, brin directSMCR8SHMT1 : 18 327 873–18 363 550, brin inverseSHMT1EVPLL : 18 377 674–18 389 652, brin directEVPLLLGALS9C : 18 476 737–18 494 945, brin directLGALS9CTBC1D28 : 18 634 247–18 644 427, brin inverseTBC1D28FOXO3B : 18 667 629–18 682 314, brin inverseFOXO3BFBXW10 : 18 744 026–18 779 349, brin directFBXW10TVP23B : 18 781 111–18 806 772, brin directTVP23BPRPSAP2 : 18 840 085–18 931 287, brin directPRPSAP2Schéma de SHMT1 : 12 exons sur le brin inverse du chromosome 17Exon 12 : 18 327 873–18 328 919, 1 047 basesExon 11 : 18 329 278–18 329 388, 111 basesExon 10 : 18 330 555–18 330 671, 117 basesExon 9 : 18 333 166–18 333 288, 123 basesExon 8 : 18 335 559–18 335 675, 117 basesExon 7 : 18 340 043–18 340 255, 213 basesExon 6 : 18 340 732–18 340 813, 82 basesExon 5 : 18 347 496–18 347 656, 161 basesExon 4 : 18 348 325–18 348 440, 116 basesExon 3 : 18 353 672–18 353 817, 146 basesExon 2 : 18 355 886–18 356 000, 115 basesExon 1 : 18 363 372–18 363 550, 179 bases1211109876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,5 kb sur les 35,7 kb du gène ; 1 452 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène SHMT1 : serine hydroxymethyltransferase 1. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/shmt1

Vancouver

Dante Labs. Gène SHMT1 : serine hydroxymethyltransferase 1 [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/shmt1

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