Geen
RNU1-4
RNA, U1 small nuclear 4
- HGNC 10128↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000207389↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 6060↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 1p36.1
- Koordinaadid
- Kromosoom 1: 16 740 516–16 740 679 (GRCh38)
- Eksonid
- 1 eksoon, ulatus 0,2 kb
- Tuntud ka kui
- HSD6, U1E2, HSD2, U1D2, HSD5, U1B2, U1F, HSD7
- Varasemad tähised
- RNU1E2, RNU1G2, RNU1D2, RNU1F1, RNU1G1
- MANE Select transkript
- ENST00000384659.1NR_004421.1
- Lookuse tüüp
- Väike tuuma-RNA (snRNA)
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rnu1-4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe RNU1-4 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni RNU1-4 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.
Kuidas RNU1-4 on üles ehitatud
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 0,2 kb kogupikkusega 0,2 kb.
RNU1-4 sekventeerimine
65Kõrge
Kui raske on RNU1-4 lühikeste lugemitega sekventeerida, skaalal 0–100Iga riba näitab, kui suur osa RNU1-4 eksoni aluspaaridest asub sellist liiki keerulises piirkonnas. Skoor kaalub neid selle järgi, kui palju iga piirkond lühikeste lugemiste analüüsi raskendab: 0, kui ükski alus ei asu üheski piirkonnas, 100, kui iga alus asub kõigis neist.
- KaardistatavusLõigud, kus 100 või 250 aluspaari pikkuseid lugemeid ei saa üheselt paigutada, seega võib seal tehtud määrang puududa või olla vale. Kaal 35%.100%
- HomoloogiaSegmentaalsed duplikatsioonid: koopiad mujal genoomis, nagu paralogid ja pseudogeenid, vähemalt 90% identsusega. Kaal 30%.100%
- KordusedTandemkordused ja ühe aluse jooksud, millel lugemid libisevad ja mida need ei pruugi katta. Kaal 15%.0%
- GC-sisaldusAknad, kus G- ja C-osakaal on alla 25% või üle 65%; raamatukogu ettevalmistus katab neid nõrgalt. Kaal 10%.0%
- ViitekatvusLüngad lähedal asuvas viitekoostises, kuhu lugemised ei saa joonduda, sest järjestust seal ei ole. Kaal 10%.0%
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). RNU1-4 geen: RNA, U1 small nuclear 4. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/rnu1-4
Dante Labs. RNU1-4 geen: RNA, U1 small nuclear 4 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/rnu1-4
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast