Gen
RNU1-4
RNA, U1 small nuclear 4
- HGNC 10128↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000207389↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 6060↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 1p36.1
- Współrzędne
- Chromosom 1: 16 740 516–16 740 679 (GRCh38)
- Eksony
- 1 ekson na odcinku 0,2 kb
- Znany również jako
- HSD6, U1E2, HSD2, U1D2, HSD5, U1B2, U1F, HSD7
- Poprzednie symbole
- RNU1E2, RNU1G2, RNU1D2, RNU1F1, RNU1G1
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000384659.1NR_004421.1
- Typ locus
- Mały jądrowy RNA (snRNA)
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rnu1-4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj RNU1-4 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu RNU1-4. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.
Budowa genu RNU1-4
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 0,2 kb z 0,2 kb genu.
Sekwencjonowanie RNU1-4
65Wysoki
Jak trudno sekwencjonować RNU1-4 krótkimi odczytami, w skali 0–100Każdy słupek to udział zasad eksonowych RNU1-4 w danym rodzaju trudnego regionu. Wynik waży je zgodnie z tym, ile każda z nich kosztuje w wywołaniu wariantów z krótkich odczytów: 0, gdy żadna zasada nie znajduje się w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się we wszystkich takich regionach.
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się jednoznacznie umieścić, więc wywołanie wariantu w tych miejscach może być brakujące lub błędne. Waga 35%.100%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub więcej. Waga 30%.100%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednego zasadu, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować. Waga 15%.0%
- Zawartość GCOkna o zawartości G i C poniżej 25% lub powyżej 65%, które słabo pokrywa przygotowanie biblioteki. Waga 10%.0%
- Pokrycie referencyjneLuki w pobliskim składzie referencyjnym, w których nie ma sekwencji, do której mogłyby się dopasować odczyty. Waga 10%.0%
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen RNU1-4: RNA, U1 small nuclear 4. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/rnu1-4
Dante Labs. Gen RNU1-4: RNA, U1 small nuclear 4 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/rnu1-4
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni