Gen
RNU1-4
RNA, U1 small nuclear 4
- HGNC 10128↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000207389↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 6060↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 1p36.1
- Souřadnice
- Chromozom 1: 16 740 516–16 740 679 (GRCh38)
- Exony
- 1 exon na 0,2 kb
- Další názvy
- HSD6, U1E2, HSD2, U1D2, HSD5, U1B2, U1F, HSD7
- Předchozí symboly
- RNU1E2, RNU1G2, RNU1D2, RNU1F1, RNU1G1
- Transkript MANE Select
- ENST00000384659.1NR_004421.1
- Typ lokusu
- Malá jaderná RNA (snRNA)
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rnu1-4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si RNU1-4 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen RNU1-4. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.
Jak je RNU1-4 uspořádán
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 0,2 kb z 0,2 kb genu.
Sekvenování RNU1-4
65Vysoká
Jak obtížně se RNU1-4 sekvenuje krátkými čteními, ze 100Každý sloupec udává podíl exonových bází RNU1-4 v dané obtížné oblasti. Skóre je váží podle toho, jak moc každá z nich ztěžuje volání krátkými čteními: 0, pokud žádná báze není v žádné takové oblasti, 100, pokud je každá báze ve všech těchto oblastech.
- MapovatelnostÚseky, kde nelze čtení o délce 100 nebo 250 bp jednoznačně umístit, takže volání v nich může chybět nebo být chybné. Váha 35 %.100 %
- HomologieSegmentální duplikace: kopie jinde v genomu, například paralogy a pseudogeny, s identitou 90 % nebo vyšší. Váha 30 %.100 %
- RepeticeTandemové repetice a řetězce jedné báze, na kterých čtení sklouzávají a které nemusí přesahovat. Váha 15 %.0 %
- Obsah GCÚseky s obsahem G a C pod 25 % nebo nad 65 %, které příprava knihovny pokrývá jen slabě. Váha 10 %.0 %
- Pokrytí referenceMezery v okolní referenční sestavě, kam se krátké čtené úseky nemají kam zarovnat. Váha 10 %.0 %
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen RNU1-4: RNA, U1 small nuclear 4. Staženo 18. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/rnu1-4
Dante Labs. Gen RNU1-4: RNA, U1 small nuclear 4 [Internet]. [citováno 18. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/rnu1-4
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů