Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

PTPRT

protein tyrosine phosphatase receptor type T

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
20q12-q13.11
Koordinaadid
Kromosoom 20: 42 072 756–43 189 906 (GRCh38)
Eksonid
31 eksonit, ulatus 1117,2 kb
Valk
1441 aminohapet
Tuntud ka kui
RPTPrho, KIAA0283
MANE Select transkript
ENST00000373187.6NM_007050.6
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni PTPRT veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas PTPRT on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 20, millel on sulg kohal, kus asub PTPRT. PTPRT ja sellele lähedal asuvad 19 geeni kromosoomil 20, vahemikus 40 955 605 kuni 44 307 057.Kromosoom 2020q12-q13.11p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3341 Mb41,5 Mb42 Mb42,5 Mb43 Mb43,5 Mb44 MbTOP1: 41 028 815–41 124 487, otsene ahelTOP1PLCG1: 41 136 931–41 196 801, otsene ahelPLCG1ZHX3: 41 178 448–41 317 783, pöördne ahelZHX3LPIN3: 41 340 786–41 360 583, otsene ahelLPIN3EMILIN3: 41 359 962–41 366 855, pöördne ahelEMILIN3CHD6: 41 402 083–41 618 555, pöördne ahelCHD6PTPRT: 42 072 756–43 189 906, pöördne ahelPTPRTSRSF6: 43 457 875–43 504 984, otsene ahelSRSF6: 43 458 054–43 541 881, otsene ahelL3MBTL1: 43 489 442–43 550 954, otsene ahelL3MBTL1: 43 540 171–43 569 498, otsene ahelSGK2: 43 558 968–43 588 237, otsene ahelIFT52: 43 590 895–43 647 299, otsene ahelMYBL2: 43 667 005–43 716 495, otsene ahelMYBL2GTSF1L: 43 726 164–43 727 002, pöördne ahelGTSF1LTOX2: 43 914 802–44 069 616, otsene ahelTOX2JPH2: 44 097 006–44 189 032, pöördne ahelJPH2OSER1: 44 195 939–44 219 957, pöördne ahelOSER1GDAP1L1: 44 247 099–44 280 947, otsene ahelGDAP1L1FITM2: 44 289 046–44 311 257, pöördne ahelFITM2PTPRT skeem: 31 eksonit kromosoomi 20 pöördne ahelalEkson 31: 42 072 756–42 080 932, 8177 alustEkson 30: 42 081 882–42 082 017, 136 alustEkson 29: 42 084 682–42 084 845, 164 alustEkson 28: 42 085 728–42 085 853, 126 alustEkson 27: 42 098 421–42 098 552, 132 alustEkson 26: 42 102 124–42 102 297, 174 alustEkson 25: 42 104 569–42 104 718, 150 alustEkson 24: 42 106 786–42 106 921, 136 alustEkson 23: 42 110 333–42 110 487, 155 alustEkson 22: 42 115 199–42 115 315, 117 alustEkson 21: 42 118 403–42 118 500, 98 alustEkson 20: 42 119 935–42 119 971, 37 alustEkson 19: 42 128 754–42 128 830, 77 alustEkson 18: 42 141 915–42 142 002, 88 alustEkson 17: 42 161 352–42 161 542, 191 alustEkson 16: 42 199 240–42 199 388, 149 alustEkson 15: 42 236 229–42 236 258, 30 alustEkson 14: 42 248 687–42 248 822, 136 alustEkson 13: 42 282 489–42 282 525, 37 alustEkson 12: 42 315 723–42 315 996, 274 alustEkson 11: 42 350 628–42 350 730, 103 alustEkson 10: 42 352 084–42 352 285, 202 alustEkson 9: 42 448 220–42 448 329, 110 alustEkson 8: 42 472 266–42 472 562, 297 alustEkson 7: 42 677 866–42 678 159, 294 alustEkson 6: 42 756 462–42 756 636, 175 alustEkson 5: 42 771 435–42 771 550, 116 alustEkson 4: 42 780 218–42 780 299, 82 alustEkson 3: 42 791 195–42 791 466, 272 alustEkson 2: 42 885 807–42 885 932, 126 alustEkson 1: 43 189 646–43 189 906, 261 alust312015′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 12,6 kb kogupikkusega 1117,2 kb; neist 4326 alust kodeerivad valku.

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). PTPRT geen: protein tyrosine phosphatase receptor type T. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/ptprt

Vancouver

Dante Labs. PTPRT geen: protein tyrosine phosphatase receptor type T [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/ptprt

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test