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Gène

PTPRT

protein tyrosine phosphatase receptor type T

Résumé

Localisation cytogénétique
20q12-q13.11
Coordonnées
Chromosome 20 : 42 072 756–43 189 906 (GRCh38)
Exons
31 exons sur 1 117,2 kb
Protéine
1 441 acides aminés
Aussi appelé
RPTPrho, KIAA0283
Transcrit MANE Select
ENST00000373187.6NM_007050.6
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore PTPRT. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de PTPRT

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 20, avec un crochet à l'emplacement de PTPRT. PTPRT et 19 gènes à proximité sur le chromosome 20, de 40 955 605 à 44 307 057.Chromosome 2020q12-q13.11p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3341 Mb41,5 Mb42 Mb42,5 Mb43 Mb43,5 Mb44 MbTOP1 : 41 028 815–41 124 487, brin directTOP1PLCG1 : 41 136 931–41 196 801, brin directPLCG1ZHX3 : 41 178 448–41 317 783, brin inverseZHX3LPIN3 : 41 340 786–41 360 583, brin directLPIN3EMILIN3 : 41 359 962–41 366 855, brin inverseEMILIN3CHD6 : 41 402 083–41 618 555, brin inverseCHD6PTPRT : 42 072 756–43 189 906, brin inversePTPRTSRSF6 : 43 457 875–43 504 984, brin directSRSF6 : 43 458 054–43 541 881, brin directL3MBTL1 : 43 489 442–43 550 954, brin directL3MBTL1 : 43 540 171–43 569 498, brin directSGK2 : 43 558 968–43 588 237, brin directIFT52 : 43 590 895–43 647 299, brin directMYBL2 : 43 667 005–43 716 495, brin directMYBL2GTSF1L : 43 726 164–43 727 002, brin inverseGTSF1LTOX2 : 43 914 802–44 069 616, brin directTOX2JPH2 : 44 097 006–44 189 032, brin inverseJPH2OSER1 : 44 195 939–44 219 957, brin inverseOSER1GDAP1L1 : 44 247 099–44 280 947, brin directGDAP1L1FITM2 : 44 289 046–44 311 257, brin inverseFITM2Schéma de PTPRT : 31 exons sur le brin inverse du chromosome 20Exon 31 : 42 072 756–42 080 932, 8 177 basesExon 30 : 42 081 882–42 082 017, 136 basesExon 29 : 42 084 682–42 084 845, 164 basesExon 28 : 42 085 728–42 085 853, 126 basesExon 27 : 42 098 421–42 098 552, 132 basesExon 26 : 42 102 124–42 102 297, 174 basesExon 25 : 42 104 569–42 104 718, 150 basesExon 24 : 42 106 786–42 106 921, 136 basesExon 23 : 42 110 333–42 110 487, 155 basesExon 22 : 42 115 199–42 115 315, 117 basesExon 21 : 42 118 403–42 118 500, 98 basesExon 20 : 42 119 935–42 119 971, 37 basesExon 19 : 42 128 754–42 128 830, 77 basesExon 18 : 42 141 915–42 142 002, 88 basesExon 17 : 42 161 352–42 161 542, 191 basesExon 16 : 42 199 240–42 199 388, 149 basesExon 15 : 42 236 229–42 236 258, 30 basesExon 14 : 42 248 687–42 248 822, 136 basesExon 13 : 42 282 489–42 282 525, 37 basesExon 12 : 42 315 723–42 315 996, 274 basesExon 11 : 42 350 628–42 350 730, 103 basesExon 10 : 42 352 084–42 352 285, 202 basesExon 9 : 42 448 220–42 448 329, 110 basesExon 8 : 42 472 266–42 472 562, 297 basesExon 7 : 42 677 866–42 678 159, 294 basesExon 6 : 42 756 462–42 756 636, 175 basesExon 5 : 42 771 435–42 771 550, 116 basesExon 4 : 42 780 218–42 780 299, 82 basesExon 3 : 42 791 195–42 791 466, 272 basesExon 2 : 42 885 807–42 885 932, 126 basesExon 1 : 43 189 646–43 189 906, 261 bases312015′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 12,6 kb sur les 1 117,2 kb du gène ; 4 326 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène PTPRT : protein tyrosine phosphatase receptor type T. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ptprt

Vancouver

Dante Labs. Gène PTPRT : protein tyrosine phosphatase receptor type T [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ptprt

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