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Gen

PTPRT

protein tyrosine phosphatase receptor type T

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
20q12-q13.11
Koordinaten
Chromosom 20: 42.072.756–43.189.906 (GRCh38)
Exons
31 Exons über 1.117,2 kb
Protein
1.441 Aminosäuren
Auch bekannt als
RPTPrho, KIAA0283
MANE-Select-Transkript
ENST00000373187.6NM_007050.6
Locus-Typ
gene with protein product
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

ReferenzgenomGRCh38

Die Positionen auf den Gen- und Variantenseiten richten sich nach dieser Auswahl, in diesem Browser.

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet PTPRT bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von PTPRT

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 20, mit einer Klammer, an der PTPRT liegt. PTPRT und 19 Gene in der Nähe auf Chromosom 20, von 40.955.605 bis 44.307.057.Chromosom 2020q12-q13.11p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3341 Mb41,5 Mb42 Mb42,5 Mb43 Mb43,5 Mb44 MbTOP1: 41.028.815–41.124.487, Plus-StrangTOP1PLCG1: 41.136.931–41.196.801, Plus-StrangPLCG1ZHX3: 41.178.448–41.317.783, Minus-StrangZHX3LPIN3: 41.340.786–41.360.583, Plus-StrangLPIN3EMILIN3: 41.359.962–41.366.855, Minus-StrangEMILIN3CHD6: 41.402.083–41.618.555, Minus-StrangCHD6PTPRT: 42.072.756–43.189.906, Minus-StrangPTPRTSRSF6: 43.457.875–43.504.984, Plus-StrangSRSF6: 43.458.054–43.541.881, Plus-StrangL3MBTL1: 43.489.442–43.550.954, Plus-StrangL3MBTL1: 43.540.171–43.569.498, Plus-StrangSGK2: 43.558.968–43.588.237, Plus-StrangIFT52: 43.590.895–43.647.299, Plus-StrangMYBL2: 43.667.005–43.716.495, Plus-StrangMYBL2GTSF1L: 43.726.164–43.727.002, Minus-StrangGTSF1LTOX2: 43.914.802–44.069.616, Plus-StrangTOX2JPH2: 44.097.006–44.189.032, Minus-StrangJPH2OSER1: 44.195.939–44.219.957, Minus-StrangOSER1GDAP1L1: 44.247.099–44.280.947, Plus-StrangGDAP1L1FITM2: 44.289.046–44.311.257, Minus-StrangFITM2Diagramm von PTPRT: 31 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 20Exon 31: 42.072.756–42.080.932, 8.177 BasenExon 30: 42.081.882–42.082.017, 136 BasenExon 29: 42.084.682–42.084.845, 164 BasenExon 28: 42.085.728–42.085.853, 126 BasenExon 27: 42.098.421–42.098.552, 132 BasenExon 26: 42.102.124–42.102.297, 174 BasenExon 25: 42.104.569–42.104.718, 150 BasenExon 24: 42.106.786–42.106.921, 136 BasenExon 23: 42.110.333–42.110.487, 155 BasenExon 22: 42.115.199–42.115.315, 117 BasenExon 21: 42.118.403–42.118.500, 98 BasenExon 20: 42.119.935–42.119.971, 37 BasenExon 19: 42.128.754–42.128.830, 77 BasenExon 18: 42.141.915–42.142.002, 88 BasenExon 17: 42.161.352–42.161.542, 191 BasenExon 16: 42.199.240–42.199.388, 149 BasenExon 15: 42.236.229–42.236.258, 30 BasenExon 14: 42.248.687–42.248.822, 136 BasenExon 13: 42.282.489–42.282.525, 37 BasenExon 12: 42.315.723–42.315.996, 274 BasenExon 11: 42.350.628–42.350.730, 103 BasenExon 10: 42.352.084–42.352.285, 202 BasenExon 9: 42.448.220–42.448.329, 110 BasenExon 8: 42.472.266–42.472.562, 297 BasenExon 7: 42.677.866–42.678.159, 294 BasenExon 6: 42.756.462–42.756.636, 175 BasenExon 5: 42.771.435–42.771.550, 116 BasenExon 4: 42.780.218–42.780.299, 82 BasenExon 3: 42.791.195–42.791.466, 272 BasenExon 2: 42.885.807–42.885.932, 126 BasenExon 1: 43.189.646–43.189.906, 261 Basen312015′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 12,6 kb der 1.117,2 kb des Gens aus; 4.326 dieser Basen kodieren für das Protein.

Woher diese Angaben stammen

  • HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
  • MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.

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APA

Dante Labs. (o. J.). PTPRT-Gen: protein tyrosine phosphatase receptor type T. Abgerufen am 17. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/ptprt

Vancouver

Dante Labs. PTPRT-Gen: protein tyrosine phosphatase receptor type T [Internet]. [zitiert am 17. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/ptprt

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