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Gen

SELENOO

selenoprotein O

Resumen

Localización citogenética
22q13.33
Coordenadas
Cromosoma 22: 50.201.011–50.217.616 (GRCh38)
Exones
9 exones en 16,6 kb
Proteína
669 aminoácidos
También conocido como
SELO
Transcrito MANE Select
ENST00000380903.7NM_031454.2
Tipo de locus
Codificantes de proteínas

Informes revisados relevantes para este gen

Ningún informe de Genome Test lee aún SELENOO. La prueba secuencia todo su genoma, así que sus datos lo incluyen igualmente.

Estructura de SELENOO

  • Secuencia codificante
  • Región no traducida
  • Intrón
  • Sentido de la transcripción
  • Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Cromosoma 22, con un corchete donde se ubica SELENOO. SELENOO y 34 genes cercanos en el cromosoma 22, desde 49.709.314 hasta 50.709.313.Cromosoma 2222q13.33p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3349,8 Mb50 Mb50,2 Mb50,4 Mb50,6 MbBRD1: 49.773.278–49.827.946, hebra inversaBRD1ZBED4: 49.853.827–49.897.383, hebra directaZBED4ALG12: 49.854.503–49.918.473, hebra inversaALG12CRELD2: 49.917.989–49.927.544, hebra directaCRELD2PIM3: 49.956.491–49.991.795, hebra directaPIM3IL17REL: 49.991.811–50.012.765, hebra inversaIL17RELTTLL8: 50.018.575–50.058.298, hebra inversaTTLL8MLC1: 50.059.391–50.085.969, hebra inversaMLC1MOV10L1: 50.090.002–50.161.690, hebra directaMOV10L1PANX2: 50.170.458–50.180.295, hebra directaPANX2TRABD: 50.184.717–50.199.600, hebra directaTRABDSELENOO: 50.201.011–50.217.616, hebra directaSELENOOTUBGCP6: 50.217.621–50.245.033, hebra inversaTUBGCP6HDAC10: 50.245.183–50.251.407, hebra inversaHDAC10MAPK12: 50.245.186–50.261.851, hebra inversaMAPK12MAPK11: 50.263.703–50.270.767, hebra inversaPLXNB2: 50.274.976–50.307.695, hebra inversaDENND6B: 50.308.989–50.327.661, hebra inversaDENND6BPPP6R2: 50.330.659–50.445.090, hebra directaPPP6R2SBF1: 50.443.219–50.483.923, hebra inversaSBF1ADM2: 50.481.516–50.486.440, hebra directaADM2MIOX: 50.486.784–50.490.648, hebra directaMIOXLMF2: 50.502.947–50.507.751, hebra inversaLMF2NCAPH2: 50.508.127–50.524.781, hebra directaSCO2: 50.523.564–50.526.461, hebra inversaSCO2TYMP: 50.525.752–50.530.326, hebra inversaCIMAP1B: 50.529.710–50.532.590, hebra inversaKLHDC7B: 50.545.899–50.551.023, hebra directaSYCE3: 50.551.109–50.562.954, hebra inversaSYCE3CPT1B: 50.567.624–50.578.681, hebra inversaCPT1BCHKB-CPT1B: 50.568.869–50.582.965, hebra inversaCHKB: 50.578.959–50.601.455, hebra inversaCHKBMAPK8IP2: 50.600.659–50.613.981, hebra directaARSA: 50.622.754–50.628.177, hebra inversaARSASHANK3: 50.674.408–50.733.212, hebra directaSHANK3Diagrama de SELENOO: 9 exones en la hebra directa del cromosoma 22Exón 1: 50.201.011–50.201.590, 580 basesExón 2: 50.206.317–50.206.520, 204 basesExón 3: 50.208.536–50.208.716, 181 basesExón 4: 50.210.181–50.210.311, 131 basesExón 5: 50.210.631–50.210.911, 281 basesExón 6: 50.215.717–50.215.867, 151 basesExón 7: 50.216.691–50.216.876, 186 basesExón 8: 50.216.972–50.217.128, 157 basesExón 9: 50.217.205–50.217.616, 412 bases1234567895′3′

Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.

Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).

Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.

Los exones suman 2,3 kb de los 16,6 kb del gen; 2010 de esas bases codifican la proteína.

Secuenciación de SELENOO

7Fácil

Qué tan difícil es secuenciar SELENOO con lecturas cortas, sobre 100

Casi todos los exones de SELENOO se encuentran en zonas donde las lecturas cortas se alinean sin problemas.

Lo que suma: la proporción de los exones de SELENOO en cada tipo de región difícil

  • Mapeabilidad0 %
  • Homología0 %
  • Repeticiones1,8 %
  • Contenido de GC64 %
  • Cobertura de referencia0 %

Una puntuación de Dante Labs basada en nuestra propia investigación, construida sobre los mapas de regiones difíciles de secuenciar Genome in a Bottle del NIST.Cómo se puntúa

Enlaces externos

De dónde procede

  • HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
  • MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
  • Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.

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APA

Dante Labs. (s. f.). Gen SELENOO: selenoprotein O. Consultado el 18 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/selenoo

Vancouver

Dante Labs. Gen SELENOO: selenoprotein O [Internet]. [citado 18 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/selenoo

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