Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

SMIM40

small integral membrane protein 40

Sammanfattning

Cytogenetisk position
6p21.32
Koordinater
Kromosom 6: 33 323 628–33 329 279 (GRCh38)
Exoner
3 exoner på 5,7 kb
Protein
79 aminosyror
MANE Select-transkript
ENST00000494082.3NM_001369203.1
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser SMIM40 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är SMIM40 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 6, med en parentes där SMIM40 finns. SMIM40 och 38 gener i närheten på kromosom 6, från 32 826 454 till 33 826 453.Kromosom 66p21.32p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2733 Mb33,2 Mb33,4 Mb33,6 Mb33,8 Mb: 32 813 767–32 838 822, bakåt-strängTAP2: 32 821 833–32 838 802, bakåt-strängTAP2PSMB8: 32 840 717–32 844 679, bakåt-strängPSMB8PSMB9: 32 844 136–32 882 881, framåt-strängPSMB9TAP1: 32 845 204–32 854 026, bakåt-strängTAP1HLA-DMB: 32 929 338–32 941 490, bakåt-strängHLA-DMB: 32 937 364–32 953 122, bakåt-strängHLA-DMA: 32 948 613–32 969 094, bakåt-strängHLA-DMABRD2: 32 968 564–32 981 505, framåt-strängBRD2HLA-DOA: 33 004 178–33 009 617, bakåt-strängHLA-DOAHLA-DPA1: 33 064 569–33 080 781, bakåt-strängHLA-DPA1HLA-DPB1: 33 073 786–33 091 655, framåt-strängHLA-DPB1COL11A2: 33 162 681–33 192 802, bakåt-strängRXRB: 33 193 585–33 200 693, bakåt-strängRXRBSLC39A7: 33 200 305–33 204 439, framåt-strängSLC39A7HSD17B8: 33 204 631–33 206 831, framåt-strängHSD17B8RING1: 33 208 033–33 212 722, framåt-strängRING1VPS52: 33 250 272–33 272 047, bakåt-strängVPS52RPS18: 33 271 730–33 276 513, framåt-strängB3GALT4: 33 277 123–33 284 832, framåt-strängWDR46: 33 279 103–33 289 523, bakåt-strängPFDN6: 33 288 680–33 298 441, framåt-strängRGL2: 33 291 180–33 299 534, bakåt-strängTAPBP: 33 299 694–33 314 284, bakåt-strängZBTB22: 33 314 406–33 318 021, bakåt-strängZBTB22DAXX: 33 318 558–33 323 259, bakåt-strängDAXX: 33 321 386–33 329 286, bakåt-strängSMIM40: 33 323 628–33 329 279, bakåt-strängSMIM40KIFC1: 33 391 429–33 410 441, framåt-strängKIFC1PHF1: 33 410 360–33 416 453, framåt-strängPHF1CUTA: 33 416 442–33 418 381, bakåt-strängCUTASYNGAP1: 33 419 661–33 453 689, framåt-strängSYNGAP1ZBTB9: 33 453 970–33 457 544, framåt-strängZBTB9BAK1: 33 568 791–33 580 305, bakåt-strängBAK1ITPR3: 33 620 331–33 696 575, framåt-strängITPR3UQCC2: 33 690 635–33 711 748, bakåt-strängUQCC2IP6K3: 33 721 314–33 750 520, bakåt-strängIP6K3LEMD2: 33 771 202–33 789 173, bakåt-strängLEMD2MLN: 33 794 673–33 804 006, bakåt-strängMLNDiagram över SMIM40: 3 exoner på bakåt-strängen av kromosom 6Exon 3: 33 323 628–33 323 864, 237 baserExon 2: 33 323 971–33 324 030, 60 baserExon 1: 33 328 987–33 329 279, 293 baser3215′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 0,6 kb av genens 5,7 kb, och 240 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av SMIM40

0Låg

Hur svår SMIM40 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

  • Mappbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Upprepningar0 %
  • GC-innehåll0 %
  • Referenstäckning0 %

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). SMIM40-genen: small integral membrane protein 40. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/smim40

Vancouver

Dante Labs. SMIM40-genen: small integral membrane protein 40 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/smim40

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test