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Gene

RPUSD1

RNA pseudouridine synthase domain containing 1

Resumo

Localização citogenética
16p13.3
Coordenadas
Cromossoma 16: 784 974–788 381 (GRCh38)
Exões
6 exões ao longo de 3,4 kb
Proteína
312 aminoácidos
Também conhecido como
RLUCL, MGC19600
Símbolos anteriores
C16orf40
Transcrito MANE Select
ENST00000007264.7NM_058192.3
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa RPUSD1 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como RPUSD1 está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
Cromossoma 16, com um parêntese onde se situa RPUSD1. RPUSD1 e 40 genes próximos no cromossoma 16, de 286 678 a 1 286 677.Cromossoma 1616p13.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.30,4 Mb0,6 Mb0,8 Mb1 Mb1,2 MbPDIA2: 283 152–287 215, fita diretaPDIA2AXIN1: 287 440–352 734, fita inversaAXIN1MRPL28: 365 449–371 289, fita inversaMRPL28PGAP6: 370 779–387 113, fita inversaPGAP6NME4: 396 725–410 367, fita diretaNME4DECR2: 401 834–412 492, fita diretaDECR2RAB11FIP3: 425 593–523 012, fita diretaRAB11FIP3CAPN15: 527 698–554 636, fita diretaCAPN15PRR35: 559 688–565 532, fita diretaPRR35PIGQ: 566 995–584 121, fita diretaPIGQNHLRC4: 567 000–569 495, fita diretaNHLRC4RAB40C: 589 007–629 348, fita diretaRAB40CWFIKKN1: 629 239–634 117, fita diretaMETTL26: 634 412–636 378, fita inversaMCRIP2: 636 817–648 475, fita diretaMCRIP2WDR90: 649 287–667 837, fita diretaWDR90RHOT2: 668 081–674 174, fita diretaRHBDL1: 675 605–678 275, fita diretaSTUB1: 679 980–682 870, fita diretaJMJD8: 681 666–684 528, fita inversaJMJD8WDR24: 684 614–690 444, fita inversaFBXL16: 692 498–705 860, fita inversaMETRN: 715 093–719 796, fita diretaMETRNANTKMT: 720 581–722 590, fita diretaCCDC78: 722 581–726 954, fita inversaCCDC78HAGHL: 726 494–735 525, fita diretaCIAO3: 729 721–741 329, fita inversaCIAO3MSLN: 760 729–768 866, fita diretaMSLNL: 769 428–782 054, fita inversaMSLNLRPUSD1: 784 974–788 381, fita inversaRPUSD1CHTF18: 788 046–800 737, fita diretaCHTF18GNG13: 798 020–800 770, fita inversaGNG13LMF1: 853 618–981 318, fita inversaLMF1SOX8: 981 444–986 979, fita diretaSOX8SSTR5: 1 063 867–1 081 470, fita diretaSSTR5C1QTNF8: 1 088 226–1 099 401, fita inversaC1QTNF8CACNA1H: 1 153 099–1 224 169, fita diretaCACNA1HTPSG1: 1 221 651–1 225 793, fita inversaTPSG1TPSB2: 1 227 272–1 233 725, fita inversaTPSB2TPSAB1: 1 239 266–1 242 555, fita diretaTPSAB1TPSD1: 1 256 059–1 259 008, fita diretaTPSD1Diagrama de RPUSD1: 6 exões na cadeia inversa do cromossoma 16Exão 6: 784 974–786 377, 1404 basesExão 5: 786 827–786 928, 102 basesExão 4: 787 077–787 179, 103 basesExão 3: 787 354–787 477, 124 basesExão 2: 787 556–787 744, 189 basesExão 1: 788 256–788 381, 126 bases6543215′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 2 kb dos 3,4 kb do gene; 939 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de RPUSD1

9Fácil

Dificuldade de sequenciação de RPUSD1 com leituras curtas, em 100

Quase todos os exões de RPUSD1 se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham com clareza.

O que acresce: a proporção dos exões de RPUSD1 em cada tipo de região difícil

  • Mapeabilidade0%
  • Homologia0%
  • Repetições0,6%
  • Conteúdo GC89%
  • Cobertura da referência0%

Uma pontuação da Dante Labs, baseada na nossa própria investigação e construída sobre os mapas de regiões de difícil sequenciação Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuação

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene RPUSD1: RNA pseudouridine synthase domain containing 1. Consultado em 18 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/rpusd1

Vancouver

Dante Labs. Gene RPUSD1: RNA pseudouridine synthase domain containing 1 [Internet]. [consultado em 18 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/rpusd1

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