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Gene

PCIF1

phosphorylated CTD interacting factor 1

Resumo

Localização citogenética
20q13.12
Coordenadas
Cromossoma 20: 45 934 683–45 948 020 (GRCh38)
Exões
17 exões ao longo de 13,3 kb
Proteína
704 aminoácidos
Também conhecido como
bA465L10.1, PPP1R121, CAPAM, MT-A70
Símbolos anteriores
C20orf67
Transcrito MANE Select
ENST00000372409.8NM_022104.4
Tipo de locus
gene with protein product
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Genoma de referênciaGRCh38

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Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa PCIF1 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como PCIF1 está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 20, com um parêntese onde se situa PCIF1. PCIF1 e 33 genes próximos no cromossoma 20, de 45 441 352 a 46 441 351.Cromossoma 2020q13.12p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3345,6 Mb45,8 Mb46 Mb46,2 Mb46,4 MbPIGT: 45 416 084–45 456 934, fita diretaPIGTWFDC2: 45 469 166–45 481 533, fita diretaWFDC2SPINT3: 45 512 461–45 515 622, fita inversaWFDC6: 45 533 091–45 539 496, fita inversaWFDC6EPPIN-WFDC6: 45 534 196–45 547 662, fita inversaEPPIN-WFDC6EPPIN: 45 540 626–45 547 786, fita inversaEPPINWFDC8: 45 551 153–45 579 326, fita inversaWFDC8WFDC9: 45 607 939–45 631 284, fita inversaWFDC9WFDC10A: 45 629 733–45 631 196, fita diretaWFDC10AWFDC11: 45 648 563–45 670 270, fita inversaWFDC11WFDC10B: 45 684 651–45 705 019, fita inversaWFDC10BWFDC13: 45 702 038–45 708 817, fita diretaWFDC13SPINT4: 45 722 347–45 725 830, fita diretaSPINT4WFDC3: 45 747 944–45 791 932, fita inversaWFDC3DNTTIP1: 45 791 937–45 811 427, fita diretaUBE2C: 45 812 561–45 816 965, fita diretaUBE2CTNNC2: 45 823 214–45 833 745, fita inversaTNNC2SNX21: 45 833 633–45 843 276, fita diretaSNX21ACOT8: 45 841 709–45 857 435, fita inversaACOT8ZSWIM3: 45 857 591–45 879 131, fita diretaZSWIM1: 45 881 201–45 885 266, fita diretaSPATA25: 45 886 491–45 887 626, fita inversaNEURL2: 45 888 002–45 891 220, fita inversaNEURL2CTSA: 45 890 144–45 898 949, fita diretaCTSAPLTP: 45 897 535–45 912 235, fita inversaPLTPPCIF1: 45 934 683–45 948 020, fita diretaPCIF1ZNF335: 45 948 653–45 972 358, fita inversaZNF335MMP9: 46 008 869–46 016 561, fita diretaMMP9SLC12A5: 46 021 675–46 060 150, fita diretaSLC12A5NCOA5: 46 060 984–46 089 973, fita inversaNCOA5CD40: 46 118 240–46 130 378, fita diretaCD40CDH22: 46 173 737–46 309 009, fita inversaCDH22SLC35H1: 46 345 980–46 364 460, fita inversaSLC35H1ELMO2: 46 366 045–46 432 985, fita inversaELMO2Diagrama de PCIF1: 17 exões na cadeia direta do cromossoma 20Exão 1: 45 934 683–45 934 804, 122 basesExão 2: 45 937 418–45 937 585, 168 basesExão 3: 45 938 981–45 939 123, 143 basesExão 4: 45 939 215–45 939 339, 125 basesExão 5: 45 940 475–45 940 612, 138 basesExão 6: 45 940 809–45 940 939, 131 basesExão 7: 45 941 053–45 941 207, 155 basesExão 8: 45 943 097–45 943 244, 148 basesExão 9: 45 943 340–45 943 423, 84 basesExão 10: 45 943 666–45 943 765, 100 basesExão 11: 45 944 868–45 945 030, 163 basesExão 12: 45 945 711–45 945 883, 173 basesExão 13: 45 946 029–45 946 115, 87 basesExão 14: 45 946 200–45 946 384, 185 basesExão 15: 45 947 073–45 947 166, 94 basesExão 16: 45 947 263–45 947 438, 176 basesExão 17: 45 947 524–45 948 020, 497 bases1246810121416175′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 2,7 kb dos 13,3 kb do gene; 2115 dessas bases codificam a proteína.

De onde vem esta informação

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene PCIF1: phosphorylated CTD interacting factor 1. Consultado em 16 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/pcif1

Vancouver

Dante Labs. Gene PCIF1: phosphorylated CTD interacting factor 1 [Internet]. [consultado em 16 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/pcif1

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