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Gen

PCIF1

phosphorylated CTD interacting factor 1

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
20q13.12
Koordinaten
Chromosom 20: 45.934.683–45.948.020 (GRCh38)
Exons
17 Exons über 13,3 kb
Protein
704 Aminosäuren
Auch bekannt als
bA465L10.1, PPP1R121, CAPAM, MT-A70
Frühere Symbole
C20orf67
MANE-Select-Transkript
ENST00000372409.8NM_022104.4
Locus-Typ
gene with protein product
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

ReferenzgenomGRCh38

Die Positionen auf den Gen- und Variantenseiten richten sich nach dieser Auswahl, in diesem Browser.

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet PCIF1 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von PCIF1

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 20, mit einer Klammer, an der PCIF1 liegt. PCIF1 und 33 Gene in der Nähe auf Chromosom 20, von 45.441.352 bis 46.441.351.Chromosom 2020q13.12p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3345,6 Mb45,8 Mb46 Mb46,2 Mb46,4 MbPIGT: 45.416.084–45.456.934, Plus-StrangPIGTWFDC2: 45.469.166–45.481.533, Plus-StrangWFDC2SPINT3: 45.512.461–45.515.622, Minus-StrangWFDC6: 45.533.091–45.539.496, Minus-StrangWFDC6EPPIN-WFDC6: 45.534.196–45.547.662, Minus-StrangEPPIN-WFDC6EPPIN: 45.540.626–45.547.786, Minus-StrangEPPINWFDC8: 45.551.153–45.579.326, Minus-StrangWFDC8WFDC9: 45.607.939–45.631.284, Minus-StrangWFDC9WFDC10A: 45.629.733–45.631.196, Plus-StrangWFDC10AWFDC11: 45.648.563–45.670.270, Minus-StrangWFDC11WFDC10B: 45.684.651–45.705.019, Minus-StrangWFDC10BWFDC13: 45.702.038–45.708.817, Plus-StrangWFDC13SPINT4: 45.722.347–45.725.830, Plus-StrangSPINT4WFDC3: 45.747.944–45.791.932, Minus-StrangWFDC3DNTTIP1: 45.791.937–45.811.427, Plus-StrangUBE2C: 45.812.561–45.816.965, Plus-StrangUBE2CTNNC2: 45.823.214–45.833.745, Minus-StrangTNNC2SNX21: 45.833.633–45.843.276, Plus-StrangSNX21ACOT8: 45.841.709–45.857.435, Minus-StrangACOT8ZSWIM3: 45.857.591–45.879.131, Plus-StrangZSWIM1: 45.881.201–45.885.266, Plus-StrangSPATA25: 45.886.491–45.887.626, Minus-StrangNEURL2: 45.888.002–45.891.220, Minus-StrangNEURL2CTSA: 45.890.144–45.898.949, Plus-StrangCTSAPLTP: 45.897.535–45.912.235, Minus-StrangPLTPPCIF1: 45.934.683–45.948.020, Plus-StrangPCIF1ZNF335: 45.948.653–45.972.358, Minus-StrangZNF335MMP9: 46.008.869–46.016.561, Plus-StrangMMP9SLC12A5: 46.021.675–46.060.150, Plus-StrangSLC12A5NCOA5: 46.060.984–46.089.973, Minus-StrangNCOA5CD40: 46.118.240–46.130.378, Plus-StrangCD40CDH22: 46.173.737–46.309.009, Minus-StrangCDH22SLC35H1: 46.345.980–46.364.460, Minus-StrangSLC35H1ELMO2: 46.366.045–46.432.985, Minus-StrangELMO2Diagramm von PCIF1: 17 Exons auf dem Plus-Strang von Chromosom 20Exon 1: 45.934.683–45.934.804, 122 BasenExon 2: 45.937.418–45.937.585, 168 BasenExon 3: 45.938.981–45.939.123, 143 BasenExon 4: 45.939.215–45.939.339, 125 BasenExon 5: 45.940.475–45.940.612, 138 BasenExon 6: 45.940.809–45.940.939, 131 BasenExon 7: 45.941.053–45.941.207, 155 BasenExon 8: 45.943.097–45.943.244, 148 BasenExon 9: 45.943.340–45.943.423, 84 BasenExon 10: 45.943.666–45.943.765, 100 BasenExon 11: 45.944.868–45.945.030, 163 BasenExon 12: 45.945.711–45.945.883, 173 BasenExon 13: 45.946.029–45.946.115, 87 BasenExon 14: 45.946.200–45.946.384, 185 BasenExon 15: 45.947.073–45.947.166, 94 BasenExon 16: 45.947.263–45.947.438, 176 BasenExon 17: 45.947.524–45.948.020, 497 Basen1246810121416175′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 2,7 kb der 13,3 kb des Gens aus; 2.115 dieser Basen kodieren für das Protein.

Woher diese Angaben stammen

  • HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
  • MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.

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APA

Dante Labs. (o. J.). PCIF1-Gen: phosphorylated CTD interacting factor 1. Abgerufen am 16. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/pcif1

Vancouver

Dante Labs. PCIF1-Gen: phosphorylated CTD interacting factor 1 [Internet]. [zitiert am 16. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/pcif1

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