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Gene

HMGXB4

HMG-box containing 4

Resumo

Localização citogenética
22q12.3
Coordenadas
Cromossoma 22: 35 257 493–35 295 807 (GRCh38)
Exões
11 exões ao longo de 38,3 kb
Proteína
601 aminoácidos
Também conhecido como
THC211630, P53N
Símbolos anteriores
HMG2L1
Transcrito MANE Select
ENST00000216106.6NM_001003681.3
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa HMGXB4 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como HMGXB4 está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 22, com um parêntese onde se situa HMGXB4. HMGXB4 e 9 genes próximos no cromossoma 22, de 34 776 650 a 35 776 649.Cromossoma 2222q12.3p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3334,8 Mb35 Mb35,2 Mb35,4 Mb35,6 MbISX: 35 066 136–35 087 392, fita diretaISXHMGXB4: 35 257 493–35 295 807, fita diretaHMGXB4TOM1: 35 299 275–35 351 740, fita diretaTOM1HMOX1: 35 380 361–35 394 214, fita diretaHMOX1MCM5: 35 400 076–35 452 656, fita diretaMCM5RASD2: 35 539 796–35 554 003, fita diretaRASD2MB: 35 606 764–35 637 951, fita inversaMBAPOL6: 35 648 128–35 668 409, fita diretaAPOL6APOL5: 35 717 872–35 729 483, fita diretaAPOL5RBFOX2: 35 738 736–36 028 824, fita inversaRBFOX2Diagrama de HMGXB4: 11 exões na cadeia direta do cromossoma 22Exão 1: 35 257 493–35 257 557, 65 basesExão 2: 35 262 323–35 262 421, 99 basesExão 3: 35 263 078–35 263 226, 149 basesExão 4: 35 263 796–35 263 874, 79 basesExão 5: 35 264 648–35 265 603, 956 basesExão 6: 35 283 962–35 284 043, 82 basesExão 7: 35 285 997–35 286 061, 65 basesExão 8: 35 287 347–35 287 452, 106 basesExão 9: 35 288 238–35 288 407, 170 basesExão 10: 35 292 992–35 293 114, 123 basesExão 11: 35 293 607–35 295 807, 2201 bases12345678910115′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 4,1 kb dos 38,3 kb do gene; 1806 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de HMGXB4

5Fácil

Grau de dificuldade de sequenciar HMGXB4 com leituras curtas, numa escala de 0 a 100

Quase todos os exões de HMGXB4 se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham de forma limpa.

O que acresce: a proporção dos exões de HMGXB4 em cada tipo de região difícil

  • Mapeabilidade0%
  • Homologia0%
  • Partilhado com o chrY0%
  • Cobertura da referência0%
  • Repetições8,5%
  • Conteúdo em GC11%

Uma pontuação da Dante Labs baseada na nossa própria investigação, construída a partir dos mapas de regiões difíceis de sequenciar Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuação

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene HMGXB4: HMG-box containing 4. Consultado em 19 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/hmgxb4

Vancouver

Dante Labs. Gene HMGXB4: HMG-box containing 4 [Internet]. [consultado em 19 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/hmgxb4

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