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Gene

HMGXB4

HMG-box containing 4

Sintesi

Localizzazione citogenetica
22q12.3
Coordinate
Cromosoma 22: 35.257.493–35.295.807 (GRCh38)
Esoni
11 esoni su 38,3 kb
Proteina
601 amminoacidi
Noto anche come
THC211630, P53N
Simboli precedenti
HMG2L1
Trascritto MANE Select
ENST00000216106.6NM_001003681.3
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora HMGXB4. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di HMGXB4

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 22, con una parentesi dove si trova HMGXB4. HMGXB4 e 9 geni nelle vicinanze sul cromosoma 22, da 34.776.650 a 35.776.649.Cromosoma 2222q12.3p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3334,8 Mb35 Mb35,2 Mb35,4 Mb35,6 MbISX: 35.066.136–35.087.392, filamento direttoISXHMGXB4: 35.257.493–35.295.807, filamento direttoHMGXB4TOM1: 35.299.275–35.351.740, filamento direttoTOM1HMOX1: 35.380.361–35.394.214, filamento direttoHMOX1MCM5: 35.400.076–35.452.656, filamento direttoMCM5RASD2: 35.539.796–35.554.003, filamento direttoRASD2MB: 35.606.764–35.637.951, filamento inversoMBAPOL6: 35.648.128–35.668.409, filamento direttoAPOL6APOL5: 35.717.872–35.729.483, filamento direttoAPOL5RBFOX2: 35.738.736–36.028.824, filamento inversoRBFOX2Diagramma di HMGXB4: 11 esoni sul filamento diretto del cromosoma 22Esone 1: 35.257.493–35.257.557, 65 basiEsone 2: 35.262.323–35.262.421, 99 basiEsone 3: 35.263.078–35.263.226, 149 basiEsone 4: 35.263.796–35.263.874, 79 basiEsone 5: 35.264.648–35.265.603, 956 basiEsone 6: 35.283.962–35.284.043, 82 basiEsone 7: 35.285.997–35.286.061, 65 basiEsone 8: 35.287.347–35.287.452, 106 basiEsone 9: 35.288.238–35.288.407, 170 basiEsone 10: 35.292.992–35.293.114, 123 basiEsone 11: 35.293.607–35.295.807, 2201 basi12345678910115′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 4,1 kb dei 38,3 kb del gene; 1806 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di HMGXB4

2Bassa

Quanto è difficile sequenziare HMGXB4 con letture corte, su 100

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni8,5%
  • Contenuto di GC11%
  • Copertura di riferimento0%

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene HMGXB4: HMG-box containing 4. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/hmgxb4

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Dante Labs. Gene HMGXB4: HMG-box containing 4 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/hmgxb4

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