Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

HMGXB4

HMG-box containing 4

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
22q12.3
Koordinater
Kromosom 22: 35 257 493–35 295 807 (GRCh38)
Eksoner
11 eksoner over 38,3 kb
Protein
601 aminosyrer
Også kjent som
THC211630, P53N
Tidligere symboler
HMG2L1
MANE Select-transkripsjon
ENST00000216106.6NM_001003681.3
Lokustype
Proteinkodende
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser HMGXB4 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er HMGXB4 bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 22, med en parentes der HMGXB4 står. HMGXB4 og 9 gener i nærheten på kromosom 22, fra 34 776 650 til 35 776 649.Kromosom 2222q12.3p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3334,8 Mb35 Mb35,2 Mb35,4 Mb35,6 MbISX: 35 066 136–35 087 392, fremover-strengISXHMGXB4: 35 257 493–35 295 807, fremover-strengHMGXB4TOM1: 35 299 275–35 351 740, fremover-strengTOM1HMOX1: 35 380 361–35 394 214, fremover-strengHMOX1MCM5: 35 400 076–35 452 656, fremover-strengMCM5RASD2: 35 539 796–35 554 003, fremover-strengRASD2MB: 35 606 764–35 637 951, bakover-strengMBAPOL6: 35 648 128–35 668 409, fremover-strengAPOL6APOL5: 35 717 872–35 729 483, fremover-strengAPOL5RBFOX2: 35 738 736–36 028 824, bakover-strengRBFOX2Diagram av HMGXB4: 11 eksoner på fremover-strengen til kromosom 22Ekson 1: 35 257 493–35 257 557, 65 baserEkson 2: 35 262 323–35 262 421, 99 baserEkson 3: 35 263 078–35 263 226, 149 baserEkson 4: 35 263 796–35 263 874, 79 baserEkson 5: 35 264 648–35 265 603, 956 baserEkson 6: 35 283 962–35 284 043, 82 baserEkson 7: 35 285 997–35 286 061, 65 baserEkson 8: 35 287 347–35 287 452, 106 baserEkson 9: 35 288 238–35 288 407, 170 baserEkson 10: 35 292 992–35 293 114, 123 baserEkson 11: 35 293 607–35 295 807, 2 201 baser12345678910115′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 4,1 kb av genets 38,3 kb, og 1 806 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av HMGXB4

5Lett

Hvor vanskelig HMGXB4 er å sekvensere med korte leser, av 100

Nesten alle eksonene til HMGXB4 ligger der korte leser kan kartlegges uten problemer.

Det som kommer i tillegg: andelen av eksonene til HMGXB4 i hver type vanskelig område

  • Kartleggbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Delt med chrY0 %
  • Referansedekning0 %
  • Repetisjoner8,5 %
  • GC-innhold11 %

En Dante Labs-poengsum basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummen

Eksterne lenker

Her kommer dette fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
  • Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). HMGXB4-genet: HMG-box containing 4. Hentet 20. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/hmgxb4

Vancouver

Dante Labs. HMGXB4-genet: HMG-box containing 4 [Internett]. [sitert 20. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/hmgxb4

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test