Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA

Gen

SHOC1

shortage in chiasmata 1

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
9q31.3
Współrzędne
Chromosom 9: 111 686 171–111 794 937 (GRCh38)
Eksony
28 eksonów na odcinku 108,8 kb
Białko
1508 aminokwasów
Znany również jako
FLJ32779, Zip2, MZIP2
Poprzednie symbole
C9orf84
Transkrypt MANE Select
ENST00000682961.1NM_001378211.1
Typ locus
gene with protein product
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Genom referencyjnyGRCh38

Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu SHOC1. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu SHOC1

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Znane miejsca powodujące choroby
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 9, z nawiasem wskazującym położenie SHOC1. SHOC1 i 10 genów w pobliżu na chromosomie 9, od 111 240 554 do 112 240 553.Chromosom 99q31.3p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.3111,4 Mb111,6 Mb111,8 Mb112 Mb112,2 MbOR2K2: 111 327 229–111 330 224, nić ujemnejOR2K2ECPAS: 111 359 002–111 484 745, nić ujemnejECPASZNF483: 111 525 054–111 578 138, nić dodatniejZNF483PTGR1: 111 546 629–111 599 897, nić ujemnejPTGR1DNAJC25: 111 631 317–111 654 352, nić dodatniejDNAJC25DNAJC25-GNG10: 111 631 386–111 670 229, nić dodatniejDNAJC25-GNG10GNG10: 111 661 340–111 800 687, nić dodatniejGNG10SHOC1: 111 686 171–111 794 937, nić ujemnejSHOC1UGCG: 111 896 772–111 935 384, nić dodatniejUGCGSUSD1: 112 040 777–112 175 535, nić ujemnejSUSD1PTBP3: 112 215 071–112 333 695, nić ujemnejPTBP3Schemat SHOC1: 28 eksonów na nici ujemnej chromosomu 9Ekson 13: 3 znanych miejsc powodujących chorobęEkson 11: 1 znane miejsce powodujące chorobęEkson 28: 111 686 171–111 686 870, 700 zasadEkson 27: 111 691 551–111 692 511, 961 zasadEkson 26: 111 693 799–111 693 948, 150 zasadEkson 25: 111 694 231–111 694 362, 132 zasadEkson 24: 111 699 954–111 700 047, 94 zasadEkson 23: 111 702 105–111 702 226, 122 zasadEkson 22: 111 703 881–111 703 992, 112 zasadEkson 21: 111 705 247–111 705 364, 118 zasadEkson 20: 111 706 568–111 706 746, 179 zasadEkson 19: 111 707 855–111 707 924, 70 zasadEkson 18: 111 713 100–111 713 172, 73 zasadEkson 17: 111 714 445–111 714 623, 179 zasadEkson 16: 111 718 184–111 718 288, 105 zasadEkson 15: 111 722 409–111 722 585, 177 zasadEkson 14: 111 723 792–111 723 911, 120 zasadEkson 13: 111 727 633–111 728 049, 417 zasadEkson 12: 111 738 280–111 738 522, 243 zasadEkson 11: 111 741 476–111 741 570, 95 zasadEkson 10: 111 746 234–111 746 342, 109 zasadEkson 9: 111 748 092–111 748 199, 108 zasadEkson 8: 111 756 325–111 756 478, 154 zasadEkson 7: 111 758 084–111 758 195, 112 zasadEkson 6: 111 758 695–111 758 848, 154 zasadEkson 5: 111 775 791–111 775 975, 185 zasadEkson 4: 111 780 930–111 781 017, 88 zasadEkson 3: 111 785 912–111 786 035, 124 zasadEkson 2: 111 791 374–111 791 454, 81 zasadEkson 1: 111 794 900–111 794 937, 38 zasad28262422201816141210864215′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 5,2 kb z 108,8 kb genu; 4527 z tych zasad kodują białko.

Jak test genomu odczytuje SHOC1

5

pozycje w SHOC1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną

Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.

Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 108,8 kb genu SHOC1, łącznie z intronami, a nie tylko 5,2 kb eksonów.

Skąd pochodzą te dane

  • HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
  • Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
  • Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen SHOC1: shortage in chiasmata 1. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/shoc1

Vancouver

Dante Labs. Gen SHOC1: shortage in chiasmata 1 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/shoc1

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test