Gen
SLITRK6
SLIT and NTRK like family member 6
- HGNC 23503↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000184564↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 84189↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 13q31.1
- Koordinater
- Kromosom 13: 85 792 790–85 799 419 (GRCh38)
- Eksoner
- 2 eksoner over 6,6 kb
- Protein
- 841 aminosyrer
- Også kjent som
- FLJ22774
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000647374.2NM_032229.3
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slitrk6.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes SLITRK6 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Høy nærsynthet med sensorineural døvhet
- Syndrom med høy nærsynthet og sensorineural døvhetAutosomal recessiv
Skyldes endringer i begge kopiene av SLITRK6, som bidrar til at nervekoblinger dannes i det indre øret og påvirker øyets vekst. Tilstanden er rapportert i ulike befolkninger.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Tidlig hørselsundersøkelse veileder valg av høreapparat eller cochleaimplantat og kommunikasjonsstøtte. Briller eller kontaktlinser korrigerer myopi, og regelmessige øyekontroller bidrar til å oppdage komplikasjoner av høy myopi. Foreldre er vanligvis bærere, så bærertesting for slektninger og genetisk veiledning er tilgjengelig.
Slik er SLITRK6 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 4,2 kb av genets 6,6 kb, og 2 526 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av SLITRK6
2
posisjoner i SLITRK6 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynlig patogen
Ingen av dem ligger i et område som korte leser har problemer med.
En helgenomsekvensering dekker alle 6,6 kb av SLITRK6, inkludert introner, ikke bare de 4,2 kb med eksoner.
ClinVar pathogenic variants (2)
The SLITRK6 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 1
- Sannsynligvis patogen 1
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_032229.3(SLITRK6):c.1240C>T (p.Gln414Ter) (opens in a new tab) | high myopia-sensorineural deafness syndrome | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_032229.3(SLITRK6):c.890C>A (p.Ser297Ter) (opens in a new tab) | high myopia-sensorineural deafness syndrome | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
Egenskaper knyttet til SLITRK6
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene SLITRK6 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-19: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.19-9814e911.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). SLITRK6-genet: SLIT and NTRK like family member 6. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/slitrk6
Dante Labs. SLITRK6-genet: SLIT and NTRK like family member 6 [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/slitrk6
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker