변이
GLA P409A
NM_000169.3(GLA):c.1225C>G (p.Pro409Ala)
- p.Pro409Ala
- p.P409A
- rs878853698
- ClinVar 분류
- 병원성
- 검토 상태
- 4개 중 2개 별판정 기준 제시됨, 다수 제출자, 상충 없음
- 최종 평가일
- 2026년 9월 8일
데이터 기준 ClinVar 릴리스 2026-10-12 · Dante Labs 데이터 릴리스 2026.10.19-9814e911정보 최종 변경일: 2026년 10월 18일
이 페이지의 데이터
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library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gla/variants/p409a.json"
page <- fromJSON(url)
page$variant$name요약
P409A 변이는 GLA의 미스센스 변이입니다. 이 변이는 유전자가 암호화하는 단백질에서 아미노산 하나를 바꿉니다. ClinVar는 이 변이를 Fabry Disease에 대해 병원성으로 분류합니다 (판정 기준 제시됨, 다수 제출자, 상충 없음).
ClinVar 분류
| 질환 | 분류 | 검토 상태 | 제출 건수 | 최종 평가일 |
|---|---|---|---|---|
| Fabry DiseaseClinVar VCV000495691 (새 탭에서 열림) | 병원성 | 4개 중 2개 별판정 기준 제시됨, 다수 제출자, 상충 없음 | 2건 제출 | 2026년 9월 8일 |
ClinVar가 릴리스 2026-10-12에 기록한 분류입니다. 증거가 검토되면 ClinVar가 이 분류를 업데이트합니다.
ACMG/AMP 기준
P409A이(가) 충족하는 ACMG/AMP 기준은 GLA의 예측 효과, gnomAD, ClinVar 데이터를 바탕으로 판단됩니다.
| 기준 | 강도 | 근거 |
|---|---|---|
| PM2인구 데이터베이스에 없거나 매우 드묾 | 보조 | gnomAD 엑솜 gnomAD 게놈에서 관찰되지 않음 |
| PP5신뢰할 수 있는 출처가 병원성으로 보고함 | 보조 | ClinVar: 병원성 (판정 기준 제시됨, 다수 제출자, 상충 없음) |
이 기준만으로는: 의미 불분명.
자동으로 평가되었으며, 기능, 계산 또는 가족 근거는 사용되지 않았습니다. 임상적 분류가 아닙니다.
집단 빈도
gnomAD 4.1에 모인 사람들의 엑솜과 게놈에서 P409A의 출현 빈도입니다.
| 데이터셋 | 대립유전자 빈도 | 대립유전자 수 | 동형접합체 | 가장 흔한 집단 |
|---|---|---|---|---|
| gnomAD 엑솜 | 발견되지 않음 | 0 중 0 | 0 | |
| gnomAD 게놈 | 발견되지 않음 | 0 중 0 | 0 |
수치는 gnomAD가 공개한 gnomAD 4.1 자료입니다. 집단은 gnomAD가 추정한 유전적 기원 집단입니다. 이 값은 gnomAD 집단에서 해당 변이가 나타나는 양상을 설명할 뿐, 개인의 검사 결과를 뜻하지 않습니다.
GLA에서의 위치
P409A은(는) GLA의 MANE Select 전사체(NM_000169.3)에 있는 엑손 7개 중 7번째 엑손에 위치합니다.
분자 세부 정보
| 유전자 | GLA |
|---|---|
| 전사체 | NM_000169.3MANE Select |
| 코딩 DNA 변화 (HGVS c.) | c.1225C>G |
| 단백질 변화 (HGVS p.) | p.Pro409Alap.P409A |
| 예측되는 결과 | 미스센스missense_variant (새 탭에서 열림) |
| 예측되는 영향 | 보통 |
| 위치 (GRCh38) | chrX:101397874 G>C |
| 위치 (GRCh37) | chrX:100652862 G>C |
| dbSNP ID | rs878853698 (새 탭에서 열림) |
| ClinVar 변이 ID | VCV000495691 (새 탭에서 열림) |
| ClinVar 대립유전자 ID | 488021 |
| ClinGen 대립유전자 등록소 ID | CA413919170 (새 탭에서 열림) |
| ClinVar 이름 | NM_000169.3(GLA):c.1225C>G (p.Pro409Ala) |
다른 데이터베이스의 GLA P409A
이 변이를 분석하는 보고서 (2)
이 Genome Test 질환 보고서에서 분석하는 변이에는 P409A이(가) 포함됩니다.
| 보고서 | 질환 | 유전 방식 |
|---|---|---|
| Fabry Disease | Fabry Disease | X 연관 열성 |
| Lysosomal Storage Disease | Lysosomal storage disease (other and unspecified types) |
GLA의 다른 변이
- A15E병원성4개 중 2개 별
- A20D병원성/가능성 높은 병원성4개 중 2개 별
- A20Gfs*2병원성4개 중 2개 별
- A29Gfs*2병원성4개 중 2개 별
- A31V가능성 높은 병원성4개 중 2개 별
- A37P병원성/가능성 높은 병원성4개 중 2개 별
- A37T가능성 높은 병원성4개 중 2개 별
- A97V병원성/가능성 높은 병원성4개 중 2개 별
- A121P가능성 높은 병원성4개 중 2개 별
- A135V병원성4개 중 2개 별
한계
이 페이지는 유전 변이에 관해 공개적으로 이용 가능한 정보를 설명합니다. 진단이 아니며, 귀하나 다른 누구라도 이 변이를 가지고 있는지 여부에 대해서는 아무것도 말해 주지 않습니다.
분류 정보는 ClinVar에서 가져오며, 새로운 근거가 검토되면서 변경될 수 있습니다. 여기에 표시된 분류는 오늘의 ClinVar 분류나 검사기관이 보고한 분류와 다를 수 있습니다.
짧은 리드(short read)를 이용한 전장 유전체 시퀀싱은 일부 변이를 놓치거나 잘못 호출할 수 있으며, 특히 반복되거나 매우 유사한 DNA 구간과 큰 삽입, 결실 또는 재배열에서 그럴 수 있습니다.
귀하의 결과나 가족의 결과에 있는 변이에 대해 궁금한 점이 있다면 유전 상담사나 주치의와 상담하시기 바랍니다.
출처 및 크레딧
- ClinVar 분류 (릴리스 2026-10-12), National Center for Biotechnology Information.
- 질환 용어: Mondo Disease Ontology (릴리스 2026-10-06), CC BY 4.0 라이선스에 따라 사용.
- 유전자 기호 및 명칭: HUGO Gene Nomenclature Committee (릴리스 2026-10-16).
- 대립유전자 식별자: ClinGen Allele Registry (릴리스 2026-10-19-c4908f54).
- 참조 SNP 식별자: dbSNP (릴리스 b157), National Center for Biotechnology Information.
- 유전자-질환 연관성: Gene Curation Coalition, GenCC (릴리스 2026-10-19).
- 어려운 영역: Genome in a Bottle Consortium (릴리스 v3.6).
- 전사체: MANE (릴리스 v1.5), NCBI 및 EMBL-EBI.
- 예측된 결과: mehari (릴리스 0.11.0), 전사체 모델은 cdot 제공.
- Dante Labs 데이터 릴리스 2026.10.19-9814e911(2026년 10월 19일 기준)으로 작성됨.
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Dante Labs. (2026년 10월 18일). GLA P409A (c.1225C>G, rs878853698) (Version 2026.10.19-9814e911). 2026년 10월 20일에 검색함, https://dantelabs.com/genes/gla/variants/p409a
Dante Labs. GLA P409A (c.1225C>G, rs878853698) [Internet]. Version 2026.10.19-9814e911. 2026년 10월 18일 [인용일: 2026년 10월 20일]. 다음에서 이용 가능: https://dantelabs.com/genes/gla/variants/p409a
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