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Gene

HOXD13

homeobox D13

Sintesi

Localizzazione citogenetica
2q31.1
Coordinate
Cromosoma 2: 176.092.721–176.095.944 (GRCh38)
Esoni
2 esoni su 3,2 kb
Proteina
343 amminoacidi
Simboli precedenti
HOX4I, SPD
Trascritto MANE Select
ENST00000392539.4NM_000523.4
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora HOXD13. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di HOXD13

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
Cromosoma 2, con una parentesi dove si trova HOXD13. HOXD13 e 11 geni nelle vicinanze sul cromosoma 2, da 175.594.333 a 176.594.332.Cromosoma 22q31.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3175,6 Mb175,8 Mb176 Mb176,2 Mb176,4 MbLNPK: 175.923.863–176.002.839, filamento inversoLNPKEVX2: 176.077.472–176.083.962, filamento inversoEVX2HOXD13: 176.092.721–176.095.944, filamento direttoHOXD13HOXD12: 176.099.795–176.102.489, filamento direttoHOXD12HOXD11: 176.104.216–176.109.754, filamento direttoHOXD11HOXD10: 176.108.790–176.119.937, filamento direttoHOXD9: 176.121.229–176.127.570, filamento direttoHOXD8: 176.129.328–176.132.695, filamento direttoHOXD3: 176.136.078–176.174.483, filamento direttoHOXD4: 176.151.545–176.156.078, filamento direttoHOXD4HOXD1: 176.188.659–176.190.926, filamento direttoHOXD1MTX2: 176.269.395–176.338.025, filamento direttoMTX2Diagramma di HOXD13: 2 esoni sul filamento diretto del cromosoma 2Esone 1: 8 siti noti causativi di malattiaEsone 2: 3 siti noti causativi di malattiaEsone 1: 176.092.721–176.093.671, 951 basiEsone 2: 176.094.480–176.095.944, 1465 basi125′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2,4 kb dei 3,2 kb del gene; 1032 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge HOXD13

11

posizioni in HOXD13 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 3,2 kb di HOXD13, introni inclusi, non solo i 2,4 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene HOXD13: homeobox D13. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/hoxd13

Vancouver

Dante Labs. Gene HOXD13: homeobox D13 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/hoxd13

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