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Gene

BIRC3

baculoviral IAP repeat containing 3

Sintesi

Localizzazione citogenetica
11q22.2
Coordinate
Cromosoma 11: 102.317.484–102.339.403 (GRCh38)
Esoni
9 esoni su 21,9 kb
Proteina
604 amminoacidi
Noto anche come
cIAP2, hiap-1, MIHC, RNF49, MALT2, c-IAP2
Simboli precedenti
API2
Trascritto MANE Select
ENST00000263464.9NM_001165.5
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora BIRC3. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di BIRC3

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 11, con una parentesi dove si trova BIRC3. BIRC3 e 13 geni nelle vicinanze sul cromosoma 11, da 101.828.444 a 102.828.443.Cromosoma 1111q22.2p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25102 Mb102,2 Mb102,4 Mb102,6 Mb102,8 MbTRPC6: 101.447.437–101.872.562, filamento inversoTRPC6ANGPTL5: 101.890.660–102.026.456, filamento inversoANGPTL5CEP126: 101.914.997–102.001.062, filamento direttoCEP126CFAP300: 102.047.402–102.085.137, filamento direttoCFAP300YAP1: 102.109.968–102.233.534, filamento direttoYAP1BIRC3: 102.317.484–102.339.403, filamento direttoBIRC3BIRC2: 102.347.208–102.378.680, filamento direttoBIRC2TMEM123: 102.396.329–102.470.384, filamento inversoTMEM123MMP7: 102.520.508–102.530.853, filamento inversoMMP7MMP20: 102.576.832–102.625.332, filamento inversoMMP20MMP27: 102.691.487–102.705.778, filamento inversoMMP27MMP8: 102.711.796–102.727.050, filamento inversoMMP8MMP10: 102.770.502–102.780.628, filamento inversoMMP10MMP1: 102.789.401–102.798.167, filamento inversoMMP1Diagramma di BIRC3: 9 esoni sul filamento diretto del cromosoma 11Esone 1: 102.317.484–102.317.571, 88 basiEsone 2: 102.321.837–102.325.362, 3526 basiEsone 3: 102.325.466–102.325.565, 100 basiEsone 4: 102.328.052–102.328.130, 79 basiEsone 5: 102.328.897–102.328.945, 49 basiEsone 6: 102.330.999–102.331.241, 243 basiEsone 7: 102.335.966–102.336.220, 255 basiEsone 8: 102.336.760–102.336.801, 42 basiEsone 9: 102.336.909–102.339.403, 2495 basi1234567895′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 6,9 kb dei 21,9 kb del gene; 1815 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di BIRC3

1Facile

Quanto è difficile sequenziare BIRC3 con letture corte, su 100

Quasi tutti gli esoni di BIRC3 si trovano in regioni in cui le letture corte si allineano in modo chiaro.

A ciò si aggiunge: la quota di esoni di BIRC3 in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Ripetizioni2,6%
  • Contenuto GC7%
  • Copertura del riferimento0%

Un punteggio di Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare di NIST Genome in a Bottle.Come viene calcolato

Tratti collegati a BIRC3

L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che BIRC3 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.

Cita questa pagina

APA

Dante Labs. (s.d.). Gene BIRC3: baculoviral IAP repeat containing 3. Consultato il 18 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/birc3

Vancouver

Dante Labs. Gene BIRC3: baculoviral IAP repeat containing 3 [Internet]. [citato il 18 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/birc3

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