Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

PBXIP1

PBX homeobox interacting protein 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
1q21.3
Koordináták
1. kromoszóma: 154 944 080–154 956 099 (GRCh38)
Exonok
11 exon, összesen 12 kb
Fehérje
731 aminosav
Más néven ismert
HPIP
MANE Select transzkriptum
ENST00000368463.8NM_020524.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) PBXIP1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A PBXIP1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
1. kromoszóma, a PBXIP1 helyét zárójel jelöli. A PBXIP1 és környékén 38 gén a 1. kromoszómán, 154 450 090–155 450 089 között.1. kromoszóma1q21.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44154,6 Mb154,8 Mb155 Mb155,2 Mb155,4 MbIL6R: 154 405 141–154 469 450, előre szálIL6RSHE: 154 469 637–154 502 866, fordított szálSHETDRD10: 154 501 508–154 548 147, előre szálTDRD10UBE2Q1: 154 548 550–154 559 028, fordított szálUBE2Q1CHRNB2: 154 567 771–154 580 013, előre szálCHRNB2ADAR: 154 581 695–154 628 013, fordított szálADARKCNN3: 154 697 455–154 870 340, fordított szálKCNN3PMVK: 154 924 732–154 937 008, fordított szálPMVKPBXIP1: 154 944 080–154 956 099, fordított szálPBXIP1PYGO2: 154 957 025–154 963 853, fordított szálPYGO2SHC1: 154 962 284–154 974 452, fordított szálSHC1CKS1B: 154 974 641–154 979 256, előre szálFLAD1: 154 983 311–154 993 111, előre szálLENEP: 154 993 586–154 994 315, előre szálZBTB7B: 155 002 543–155 018 525, előre szálDCST2: 155 018 520–155 033 781, fordított szálDCST2DCST1: 155 033 824–155 050 930, előre szálDCST1ADAM15: 155 050 566–155 062 780, előre szálADAM15EFNA4: 155 063 718–155 069 553, előre szálEFNA4EFNA4-EFNA3: 155 063 748–155 086 807, előre szálEFNA3: 155 078 823–155 087 538, előre szálEFNA3EFNA1: 155 127 452–155 134 899, előre szálEFNA1SLC50A1: 155 135 344–155 138 857, előre szálSLC50A1DPM3: 155 138 457–155 140 595, fordított szálDPM3KRTCAP2: 155 169 182–155 173 475, fordított szálKRTCAP2: 155 169 409–155 187 272, fordított szálTRIM46: 155 173 787–155 184 971, előre szálMUC1: 155 185 824–155 192 916, fordított szálMUC1THBS3: 155 195 584–155 209 203, fordított szálMTX1: 155 208 695–155 213 824, előre szálGBA1: 155 231 270–155 245 178, fordított szálGBA1ENTREP3: 155 247 205–155 255 824, fordított szálENTREP3SCAMP3: 155 255 979–155 262 433, fordított szálSCAMP3CLK2: 155 262 747–155 278 491, fordított szálCLK2HCN3: 155 277 328–155 289 848, előre szálHCN3PKLR: 155 289 265–155 301 443, fordított szálFDPS: 155 304 786–155 320 666, előre szálFDPSRUSC1: 155 320 739–155 331 422, előre szálRUSC1ASH1L: 155 335 268–155 563 162, fordított szálASH1LA PBXIP1 ábrája: 11 exon a(z) 1. kromoszóma fordított szálán11. exon: 154 944 080–154 945 117, 1038 bázis10. exon: 154 945 572–154 946 803, 1232 bázis9. exon: 154 947 417–154 947 548, 132 bázis8. exon: 154 947 642–154 947 712, 71 bázis7. exon: 154 947 982–154 948 005, 24 bázis6. exon: 154 948 133–154 948 366, 234 bázis5. exon: 154 951 232–154 951 397, 166 bázis4. exon: 154 951 471–154 951 535, 65 bázis3. exon: 154 951 795–154 951 921, 127 bázis2. exon: 154 953 671–154 953 757, 87 bázis1. exon: 154 956 069–154 956 099, 31 bázis11109876543215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 12 kb-jából 3,2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2196 bázis kódolja a fehérjét.

PBXIP1 szekvenálása

4Könnyű

Mennyire nehéz a PBXIP1 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A PBXIP1 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a PBXIP1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések3,6%
  • GC-tartalom16%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). PBXIP1 gén: PBX homeobox interacting protein 1. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/pbxip1

Vancouver

Dante Labs. PBXIP1 gén: PBX homeobox interacting protein 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/pbxip1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet